在选择移动硬盘盒时，接口种类多种多样，主要包括并口、USB2.0、IEEE1394、USB3.0和eSATA等。
最早的硬盘盒接口是并口，也就是我们常说的打印口，它主要分为ECP、EPP和SPP三种模式，其中EPP和ECP支持高速数据传输，但其传输速率仍然偏低。由于并口不提供电源，使用时需要额外的电源供应，且不具备即插即用的功能。尽管价格相对便宜，但因种种局限，现在并口硬盘盒已逐渐被淘汰。
USB接口的移动硬盘盒目前是主流选择，其最大的优点在于使用方便，支持热插拔和即插即用。USB1.1和2.0标准存在，前者传输速度为12Mbps，后者高达480Mbps。大部分主板都支持USB1.1，而2.0标准通常在新主板上才可用。尽管USB2.0的价格稍高，但其性能提升显著，特别是对于大文件传输，1.1标准的等待时间会显得漫长。因此，购买USB2.0接口的硬盘盒是明智之选，即使当前主板不支持，也为未来升级预留了空间。
相比之下，IEEE1394（火线）接口理论上能达到400Mbps的传输速度，但其普及率低，需要额外购买昂贵的接口卡，导致其价格较高且不便于跨计算机共享。因此，在实际应用中，IEEE1394接口的普及性并不理想。
随着网络和多媒体的迅速发展，人们越来越经常遇到以GB为单位的大容量数据交换，面对这样大块头的数据，硬盘无疑是最佳的载体，然而普通硬盘是安装在机箱中，并且安装了操作系统，因此不易于移动。硬盘盒的作用就是对一块硬盘起到物理保护作用，同时使用便于移动的连接方式，实现移动硬盘的作用。