两个单位负责内容不一样。
中国建筑设计研究院主营业务范围涵盖前期咨询、规划、设计、工程管理、工程监理、
工程总承包、专业承包、环评和节能评价等
固定资产投资活动全过程。包括建筑工程设计与咨询、城市与小城镇规划、市政工程综合设计、城市燃气与工业煤气、污水与垃圾处理、道路桥梁设计、建筑智能化及系统工程设计、建筑标准设计、景观艺术设计、工程监理、工程总承包、居住工程、建筑标准、科技信息技术、建筑历史、建筑经济等业务及其相应科研工作。基本形成了建筑设计、城市建设规划、城市市政、建筑标准、建设信息、工程咨询、室内装饰、园林绿化、住宅研发等一体化的集团化产业构架 ；
中国建筑科学研究院以建筑工程为主要研究对象，以应用研究和开发研究为主，致力于解决我国工程建设中的关键技术问题；负责编制与管理工程建设技术标准和规范；承担国家建筑工程、空调设备、电梯和化学建材的质量监督检验和测试任务。
要说看哪家好的话，就要看你是做什么了，搞设计建设肯定只有找中国建筑设计研究院了，如果你是要做
企业标准，那就找中国建筑科学研究院
参考资料：http://www.cabr.ac.cn/