医师资格证未注册如果超过两年，需要到县级以上人民政府的卫生行政部门委托机构或者组织参加考核，考核合格后才能够重新注册。
参照《中华人民共和国执业医师法》第十三条规定，国家实行医师执业注册制度。取得医师资格的，可以向所在地县级以上人民政府卫生行政部门申请注册。 除有本法第十五条规定的情形外，受理申请的卫生行政部门应当自收到申请之日起三十日内准予注册，并发给由国务院卫生行政部门统一印制的医师执业证书。申请医师执业注册需要提交的材料：（1）医师执业注册申请审核表；（2）近6个月的2寸白底免冠正面半身照片；（3）预防、医疗、保健机构的聘用证明；（4）省级以上卫生计生行政部门规定的其他材料。注册一般由单位来统一办理，如果拿证两年后还没有注册，就需要再培训3到6个月，并通过考核后才能注册，注册后才能拿到《医师执业证书》。
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