1951年，崖子地区设立为崖子乡，随后在1958年转变为公社。1984年3月，这一行政区划改为镇级。该镇地域广阔，东西跨度17千米，南北纵长12千米，总面积达到118平方千米。当时，镇上人口总数为36405人，由41个行政村组成，包括崖子、磨山、石甲庄等，如崖子村、东夼和南寨等。
2001年3月，马石店镇经历了一次重要的变革，被并入崖子镇。马石店镇原本位于乳山市的西北部，与海阳市接壤，北邻烟台市牟平区，东与崖子镇相连，南与诸往镇为邻。这个区域的特点是多山，其历史同样悠久。1951年，这里设立了北果子乡，1958年归属崖子公社，之后在1969年独立为马石店公社。1984年3月，公社改为乡，直至1994年3月，乡级行政区划被撤销，改为马石店镇。镇内有17个行政村，如马石店村、西涝口和青山等，总面积为69.4平方千米，人口14743人，镇政府设在马石店，距离市区45千米。
崖子镇（YaziZhen）属乳山市。在乳山市区西北部。西部与北部同烟台海阳市、牟平区接壤。面积187.4平方公里，人口4.43万。原为崖子人民公社。镇政府驻崖子。