残疾人就业保障金中的在职职工工资总额计算方法是：将每个职工的工资加起来，得到所有职工的工资总额。
具体来说，首先需要确定哪些职工是在职的，然后将他们的工资数额相加。这个计算应该包括所有在职职工的基本工资、奖金、津贴和补贴等工资性收入。不论支付方式（货币或实物）、资金来源、是否计入成本，均应列入工资总额计算范围。
对于工资总额的统计，应该遵循实际支付原则，即实际支付给职工的工资总额。同时，平均工资的计算公式是职工工资总额除以职工人数。
例如，一个公司有100名在职职工，每个人的平均工资是5000元。那么这个公司的在职职工工资总额就是100名职工的工资相加，即5000元 x 100 = 500000元。
以上是一个简单的计算方法。具体的计算方法可能会因为公司的工资制度、职工的工作内容等因素而有所不同。因此，在实际计算中，需要根据公司的具体情况来确定计算方法。