分公司是不可能有独立法人地位的，但可以独立核算财务，所有收支单独记帐，单独在当地报税，总公司期末汇总分公司报表。
总公司收取分公司的管理费：由公司懂事会会议或公司章程来确定。总公司收不收取管理费用仅是你们公司内部的利润分配计算方式，因所得税要汇总计算，不会对整个公司所得税产生影响。
具体分录：视具体业务来做。总公司收取管理费用的分录建议做管理费用的内部冲销，或者挂其他应收应付等往来科目，总公司最好不要确定收入，否则又要多交一道流转税。
扩展资料：
独立核算的特点是:在管理上有独立的组织形式,具有一定数量的资金,在当地银行开户;独立进行经营活动,能同其他单位订立经济合同;独立计算盈亏,单独设置会计机构并配备会计人员,并有完整的会计工作组织体系.方便分公司自主经营.
分公司的纳税流程:分公司的流转税，必须在当地的税务机关核算缴纳，这个是流转税的基本原则。也就是到地税申报缴纳。现在基本上所有的城市国税地税申报都是网上申报，未开通网上申报的公司，可以凭借税务登记证（正本副本）营业执照，基本行开户许可证，基本行开户行信息等证件，到当地税务机关申请网上申报纳税。
分公司的所有税种的申报，都必须由总公司汇总，由总公司申报。非独立核算的分公司仅仅只是总公司的一个分支机构，相当于一个部门。一般情况下，如果分公司是个独立核算的群体，既有营业收入，又有支出，分公司虽小，但是五脏俱全。
这种情况下的分公司，从财政考核上考虑，相信很多企业领导人都会做出一个决定，总分公司财政独立，个子独立核算。独立核算下的分公司，需要向当地税务机关申报纳税。 在分公司成立之初，就可以凭借当即工商部门审批下来的分公司营业执照，总公司的营业执照等相关证件，到当地银行办理分公司基本行开户。
如果总分公司不在一个地级市，这时候的企业所得税的申报，则需根据跨区经营所得税申报原则进行申报，按照总公司所在地国税部门核准的分配比例，总公司分公司分别各自向当地所得税申报主管部门申报缴纳。
关于企业所得税的申报问题，如果总分公司在同一个地级市以内，那么无论总分公司是否独立核算，均由总公司汇总申报即可。
参考资料：百度百科——独立核算
【法律分析】
总公司管理分公司，对所属分公司在生产经营、资金调度、人事管理等方面行使指挥、管理、监督的权利，具有法人资格，可以独立承担民事责任。分公司是与总公司相对应的法律概念，是指在业务、资金、人事等方面受总公司管理，不具有法人资格的分支机构。分公司在法律、经济上没有独立性，属于总公司的附属机构。分公司是指在业务、资金、人事等方面受总公司管理而不具有法人资格的分支机构。分公司的主要特征是：1.分公司是由总公司依法设立的，分公司的主要业务活动完全由总公司决定，分公司一般是以总公司的名义并根据它的委托来进行业务活动的。2.分公司没有自己独立的财产，分公司的所有资产全部属于总公司。3.分公司不是公司，它的设立不须依照公司设立程序，只要在履行简单地登记和营业手续后即可成立。4.分公司不独立承担民事责任，没有董事会等形式的公司经营决策和业务执行机关，总公司要对分公司的债务负无限责任。5.分公司没有自己独立的名称和章程，而只能使用与总公司同样的名称和章程。虽然分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担，但分公司可以独立进行与其民事行为能力相符合的民事活动，包括以自己的名义进行诉讼。
【法律依据】
《中华人民共和国公司法》 第十四条 公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。