价格对比
种植眉毛过程复杂精密，属于微创手术，对医务人员、设施设备要求极为严格，且必须按照原生眉毛的密度方向形态种植，不能有一点错误，这样毛囊成活后，自然就会有发友想要的完美形态；而纹眉则是一种创伤性皮肤着色，是将色素植于皮肤组织内，形成稳定色块，由于表皮很薄，色素通过表皮层呈现出色泽，达到掩盖瑕疵、扬长避短、修饰美化的作用。二者之间，因为所选择的医院、机构、技术、材料等等的不同，并没有统一的收费标准，但整体来说，种植眉毛相对于纹眉来说，价格更高一些。
自然程度对比
种植的眉毛，毛囊一旦成活后，就会按照设计的形态生长，360度立体完美自然，与原生眉毛没有任何差别，且不会受雄性激素和遗传基因因素的影响；纹眉立竿见影看效果，但由于是人工着色后形成的，与真实的眉毛存在一定的差别，由于个人选择色料的不同，眉毛的颜色也不相同，虽能无限趋近原生眉颜色，但是自然程度上远远比不上种植的真眉毛。
永久性对比
种植的眉毛采用的是人后枕部长寿毛囊，一旦种植成活后，是拥有后枕毛囊的一切特性，永不脱落的，而纹眉则是会随着时间的推移，渐渐颜色减退、眉毛变形，或者随着潮流的变化，变得过时、落伍，需要人们重新纹眉或者直接洗掉，从持续性、永久性层面来说，种植眉毛比纹眉更胜一筹。