医学上的隔离可分为传染病隔离和保护性隔离两种。传染病隔离是将处于传染病期的传染病病人、可疑病人安置在指定的地点，暂时避免与周围人群接触，便于治疗和护理。
通过隔离，可以最大限度地缩小污染范围，减少传染病传播的机会。如传染病流行时的疫区、传染病院等。保护性隔离是指将免疫功能极度低下的易感染者置于基本无菌的环境中，使其免受感染，如器官移植病区等。
生物学上的隔离是指在自然界中生物不能自由交配或交配后不能产生可育后代的现象。
隔离机制如果发生在受精之前，就称为受精前隔离，包括地理隔离、生态隔离、季节隔离等；隔离机制如果发生在受精之后，就称为受精后隔离，如杂种不活、杂种不育等。
物种之间的隔离一般并不是由单个隔离机制造成的，往往是数种不同机制的组合作用。
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隔离的种类及措施：
一、严密隔离
适用于传染性强或传播途径不明的疾病所采取隔离措施。如鼠疫、霍乱等烈性传染病。要求病人住单人房间（同病种可住一室），室内物品力求简单并耐消毒，门口挂有醒目标志，禁止探视；进入病室要戴口罩、手套、穿隔离衣、换鞋，不得随意开启门窗。
物品一经进病室即视为污染，均应严格消毒处理；室内空气每日消毒1次，地面及距地面2米以下的墙壁、家具用消毒液每日擦洗1次，病人出院或死亡后病室及其一切用物应严格消毒。
二、呼吸道隔离
适用于病原体经呼吸道传播的疾病所采取的隔离方法。如麻疹、白喉、百日咳、流行性脑脊髓膜炎等。要求：同种病人可住一室，但相互间不得借用物品或传阅书籍。
接近病人时应戴口罩、帽子和穿隔离衣，并保持干燥；病人到其他科室会诊或治疗时应戴口罩，病人呼吸道分泌物经消毒后方可倒入专用下水道或焚烧，病室内空气每日消毒1次。
三、消化道隔离
适用于病原体通过污染食物、食具、手及水源，并经口引起传播的病症所给予的隔离方法。如病毒性肝炎、伤寒、细菌性痢疾等。要求：不同种病人应尽可能分室收住，如同住一室两床相距不少于2米；接触病人时应穿隔离衣，护理不同病种的病人应更换隔离衣，并消毒双手。
病人的食具、便器、呕吐物、排泄物须严密消毒；病室地面、家具每日消毒液喷洒或擦拭；病人之间不得接触或交换用物、书报等；病室应有完善的防蝇设施。
四、接触隔离
适用于病原体经皮肤或粘膜进入体内的传染病所采取的隔离方法。如破伤风、炭疽、狂犬病等。要求：不同种病人分室收住，不得接触他人；进行治疗护理时必须穿隔离衣，皮肤有破损者，避免伤口换药及护理，必要时戴手套，已被污染的用具和敷料应严格消毒或焚烧。
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