中途岛海战是美日两国海军力量发生逆转的转折点，在此之后，日本海军丧失了太平洋上的主动权。此战日本之所以会失败，除了指挥失误和情报外露的原因之外，对美国造船能力估计不足也是很大的原因。
一、日本为了获取战争资源，发动了太平洋战争
1941年6月，纳粹德国550万大军兵分三路进攻苏联。希特勒让日本提出了建议，希望东方盟友日本可以从东面牵制苏联远东地区的兵力，最好是与德军一起夹击苏联。当时美国已经对日本进行了石油和金属禁运，因此日本更希望趁着各国无暇顾及之际进军东南亚。
1941年12月，日本为了打掉自己的威胁，偷袭了美国太平洋基地珍珠港。就在同一天，日本同时进攻英国控制下的中国香港和美国控制下的菲律宾。在此战中，美国列克星敦号航母被击沉，约克城号航母重伤。日本联合舰队司令山本五十六认为自己还需要组织一次大规模的战役，准备一鼓作气全歼美国太平洋舰队主力。
二、日本认为需要3个月，但美国只用了68个小时
山本五十六计划在占领中途岛的同时全歼美国海军主力，这个计划确实非常巧妙，但是很不幸这个计划被美军情报人员成功破译。日本人之所以这么大胆，是因为他们对美国太平洋舰队的实力进行了评估。日本人认为美国最多调动两艘航母。
当时美军太平洋舰队确实只能调集两艘航母，它们是大黄蜂号和企业号。但是日本人忘记了那艘约克城号，这艘航母在被日军重创以后返回基地维修。当时山本五十六按照日本的维修时间推测这艘航母何时可以参加战斗，在日本破坏如此严重的航母需要6个月的时间，鉴于美国工业强大，这个时间减半。最终山本五十六认为在中途岛战役中，约克城号航母还会在维修，不可能加入战斗。但是他万万没有想到，美国人只用了68个小时就完成了航母最基本的修复工作。这艘航母的加入是日本没有计算到的，约克城号加入战役之后，对战役走向发生了巨大的影响。日本人出动了4艘航母，而美军拥有了3艘，但日本每艘航母的舰载机数量不如美军。最后的结果是双方舰载机数量差不多，这最终要了日本人的命。
三、战术指挥失误，最终导致了日本海军的失败
在中途岛战役中，南云忠一发生了战术指挥的错误。他命令舰载机既要进攻美国航母，又要攻击中途岛，但是这两者的性质完全不同。打击航母要使用反舰鱼雷，进攻地面目标要使用高爆炸弹，这就造成了日本航母上的混乱。虽然美军鱼雷攻击机的水平相当烂，被日军全部击落。但美军俯冲轰炸机的性能则相当优异，最终有3艘日军航母被击沉（这个数字最后变成了4艘）。返航的日军战机由于找不到己方的航母，只能选择在海上强行着陆。此战日本不但损失了4艘航母，而且损失了300多架飞机。其实最值钱的是那些战斗经验十分丰富的飞行员，在此战以后，日本战机飞行员的水平越来越差。到了1945年，甚至刚刚学会驾驶飞机就被送上了战场。
日方朝云出版社出版的《中途岛海战》，已经从根本上否定了“命运的5分钟”说法!
“南云舰队中弹时，一航战的换弹(炸弹换鱼雷)尚未完成，攻击队正在准备起飞，第一架战斗机滑出甲板时中弹的说法虽然普遍，但可以肯定的是，这架战斗机属于舰队直掩机，而不属于对美特混舰队的攻击机队的护航机。”
根据赤城舰桥上的了望员证词，中弹瞬间，赤城飞行甲板上，连一架攻击机都没有。只有3架零式战斗机。其中1架似乎属于为第2攻击队准备的掩护机，但无法断定。因为当时为第2攻击队准备的护航战斗机，几乎都在上空掩护舰队。另外2架，可以断定属于刚刚降落下来，补充弹药燃料的直掩机。
而据飞行员证词，当时起飞的1架零式战斗机，是因为其飞行员发现了正俯冲下来的美军飞机，而立刻跳上眼前飞机起飞。可以证实，赤城中弹前，其甲板上只有3架零式战斗机，而且都没有飞行员。第2攻击队的97舰攻飞行员，正在待机室里等待起飞。
实际上，赤城等航母飞行员的伤亡并不大，这也证实了他们当时应该不在飞机座舱里，因为如果他们在整齐排列在甲板上的飞机座舱里，中弹后，在极短时间内便被陆续引爆的飞机将会大批杀死其飞行员。
加贺航母中弹瞬间，甲板上是否已经排列满第2攻击队的飞机，目前没有准确说法，但有证词说97舰攻在升降机的时候中弹。
苍龙中弹瞬间，有证词说“甲板上有10架左右舰攻”。这可能是第1攻击队返回的舰攻刚刚降落，或者是为第2攻击队准备的“99俯冲轰炸机”。不管怎么说，都不能证明第2攻击队还有5分钟就能起飞。
而且，如果1，2航战是在“命运的5分钟”内中弹，那么没有中弹的飞龙应该在5分钟内起飞全部的第2攻击队战机。但实际上，飞龙第2攻击队的开始起飞时间，是在3艘航母都中弹后的30分钟。由此可见，至少飞龙也绝对不是还有5分钟就能起飞其攻击队。
至少可以下一个结论——3艘航母中弹的时刻，苍龙、飞龙的第2攻击队的起飞至少还需要30分钟，而赤城、加贺则需要更多时间。
据赤城koto中尉证词，“还有5分钟，大概是还有5分钟，机库内的攻击机队就能完成其炸弹换鱼雷的工作，然后要把一架架飞机，通过升降机提升到甲板上，在起飞位置排列好，完成试运行，然后起飞，这最少需要30分钟的时间。”
当时第1航空舰队第2航空参谋(第一参谋是源田)yoshioka少佐，在回答战后委员会提问的时候，说“命运的5分钟都是胡扯”。
即使有“命运的30分钟”或者“命运的60分钟”存在，“命运的5分钟”也是绝对不存在的。这大概是日本人独特的思维方式，“命运的5分钟”意味着“本来我们能赢”，“只是一点点的厄运”的日本人的主观愿望的投影。
再三再四的提起，论证“命运的5分钟”的日本生还将校，委员会曾经调查过他们在中途岛战役的战斗岗位，以及是否目击等问题的回答，实际上，他们的岗位以及是否目击的回答，决定了他们都不能支持“命运的5分钟”一说
1，日军自满得意，轻视美军
骄兵必败，这是日军失败的最根本原因。战争伊始，日军做了周密安排，取得效果明显。但是日军很快被这样的效果冲昏了头脑。日本后来没有了谨慎小心的态度，仓促地制定了作战计划，甚至图上演习也是敷衍了事。日本的部队官员全部抱着蔑视的态度，没有做任何准备。
2，二日军在情报中的失误
当时的战局已经向多元化发展，情报已经成为了战争胜利的关键。这次美军能够取胜的重要原因是实现破译了日本情报密码。在开战的前期，美军已经知晓了日军的战斗方案。与之相反的是，日本没有在战前搜集到任何情报，侦察活动在后来也取消了。日军方面对美军做出了完全错误的判断，这也是他们失败的原因。
3，日军分散了兵力
日军虽然投入了大量的军力，但是没有对它们进行有效的支配。美国集中了自己所有的力量。此消彼长，在数量上反而美国占尽了优势。
4，日本作战观念的落后
美国在珍珠港事件中被击沉了所有的战列舰，他们反而想出了一种新的作战战略。以航空母舰为核心，所有的舰都为航空母舰服务。日本不愿意将战列舰用来保护航空母舰，依旧把战列舰当成胜利的关键。
5，日本作战指挥犯了失误
日本的将领不仅忽视了侦察任务，还刚愎自用，不听下属的建议，导致了战机的延误。六日本和美国双方在科技水平和工业实力上的巨大差距。美国在中途岛海战中已经使用了雷达技术，但是日本依旧靠肉眼识别位置。美国修理在战场受伤的航空母舰只需要几天，能够让它再次投入战场。但是日本修理损坏的航空母舰却需要一个月。在战争后期，美国减少了在航母上与日本的差距。