（1）消毒剂的种类
针对所要消毒的微生物特点，选择恰当的消毒剂很关键，如果要杀灭细菌芽孢或非囊膜病毒，则必须选用灭菌剂或高效消毒剂，也可选用物理灭菌法，才能取得可靠的消毒效果，若使用酚制剂或季铵盐类消毒剂则效果很差；季铵盐类是阳离子表面活性剂，有杀菌作用的阳离子具有亲脂性，杀革兰氏阳性菌和囊膜病毒效果较好，但对非囊膜病毒就无能为力了。龙胆紫对葡萄球菌的效果特别强。热对结核杆菌有很强的杀灭作用，但一般消毒剂对其作用要比对常见细菌繁殖体的作用差。所以为了取得理想的消毒效果，必须根据消毒对象及消毒剂本身的特点科学地进行选择，采取合适的消毒方法使其达到最佳消毒效果。
（2）消毒剂的配方
良好的配方能显著提高消毒的效果。如用70%（W/W）乙醇配制季铵盐类消毒剂比用水配制穿透力强，杀菌效果更好；酚若制成甲酚的肥皂溶液就可杀死大多数繁殖体型微生物；超声波和戊二醛、环氧乙烷联合应用，具有协同效应，可提高消毒效力；另外，用具有杀菌作用的溶剂，如甲醇、丙二醇等配制消毒液时，常可增强消毒效果。当然消毒药之间也会产生颉颃作用，如酚类不宜与碱类消毒剂混合，阳离子表面活性剂不宜与阴离子表面活性剂（肥皂等）及碱类物质混合，它们彼此会发生中和反应，产生不溶性物质，从而降低消毒效果。次氯酸盐和过氧乙酸会被硫代硫酸钠中和。因此，消毒药不能随意混合使用，但可考虑选择几种产品轮换使用。
（3）消毒剂的浓度
任何一种消毒药的消毒效果都取决于其与微生物接触的有效浓度，同一种消毒剂的浓度不同，其消毒效果也不一样。大多数消毒剂的消毒效果与其浓度成正比，但也有些消毒剂，随着浓度的增大，消毒效果反而下降。各种消毒剂受浓度影响的程度不同。每一消毒剂都有它的最低有效浓度，要选择有效而又对人畜安全并对设备无腐蚀的杀菌浓度。若浓度过高不仅对消毒对象不利（腐蚀性、刺激性或毒性），而且势必增加消毒成本，造成浪费。
（4）作用时间
消毒剂接触微生物后，要经过一定时间后才能杀死病原，只有少数能立即产生消毒作用，所以要保证消毒剂有一定的作用时间，消毒剂与微生物接触时间越长消毒效果越好，接触时间太短往往达不到消毒效果。被消毒物上微生物数量越多，完全灭菌所需时间越长。此外，大部分消毒剂在干燥后就失去消毒作用，溶液型消毒剂在溶液中才能有效地发挥作用。
（5）温度
通常温度升高，消毒速度会加快，药物的渗透能力也会增强，可显著提高消毒效果，消毒所需要的时间也可以缩短。一般温度按等差级数增加，则消毒剂杀菌效果按几何级数增加。许多消毒剂在温度低时，反应速度缓慢，影响消毒效果，甚至不能发挥消毒作用。如福尔马林在室温15℃以下用于消毒时，即使用其有效浓度，也不能达到很好的消毒效果，但室温在20℃以上时，则消毒效果很好。
（6）湿度
湿度对许多气体消毒剂的作用有显著影响。这种影响来自两方面：一是消毒对象的湿度，它直接影响微生物的含水量。如用环氧乙烷消毒时，细菌含水量太多，则需要延长消毒时间；细菌含水量太少，消毒效果亦明显降低。二是消毒环境的相对湿度。每种气体消毒剂都有其适宜的相对湿度范围，如甲醛以相对湿度大于60%为宜，用过氧乙酸消毒时要求相对湿度不低于40%，以60%～80%为宜。直接喷洒消毒剂干粉处理地面时，需要有较高的相对湿度，使药物潮解后才能发挥作用。而紫外线消毒时，相对湿度增高，反而影响穿透力，不利于消毒处理。
（7）酸碱度（pH）
pH可从两方面影响消毒效果，一是对消毒剂的作用，pH变化可改变其溶解度、离解度和分子结构；二是对微生物的影响，病原微生物的适宜pH在6～8之间，过高或过低的pH有利于杀灭病原微生物。酚类、次氯酸等是以非离解形式起杀菌作用，所以在酸性环境中杀灭微生物的作用较强，碱性环境就差。在偏碱性时，细菌带负电荷多，有利于阳离子型消毒剂的作用；而对阴离子消毒剂来说，酸性条件下消毒效果更好些。新型的消毒剂常含有缓冲剂等成分，可以减少pH对消毒效果的直接影响。
（8）表面活性剂和稀释用水的水质
非离子表面活性剂和大分子聚合物可以降低季铵盐类消毒剂的作用，阴离子表面活性剂会影响季铵盐类的消毒作用。因此，在用表面活性剂消毒时应格外小心。由于水中金属离子（如Ca2+和Mg2+）对消毒效果也有影响，所以，在稀释消毒剂时，必须考虑稀释用水的硬度问题。如季铵盐类消毒剂在硬水环境中消毒效果不好，最好选用蒸馏水进行稀释。一种好的消毒剂应该能耐受各种不同的水质，不管是硬水还是软水，消毒效果都不受影响。
（9）有机物的存在
消毒现场通常会遇到各种有机物，如血液、血清、培养基成分、分泌物、脓液、饲料残渣、泥土及粪便等，这些有机物的存在会严重干扰消毒剂消毒效果。因为有机物覆盖在病原微生物表面，妨碍消毒剂与病原直接接触而延迟消毒反应，以致于对病原杀不死、杀不全。部分有机物可与消毒剂发生反应生成溶解度更低或杀菌能力更弱的物质，甚至产生的不溶性物质反过来与其他组分一起对病原微生物起到机械保护作用，阻碍消毒过程的顺利进行。同时有机物消耗部分消毒剂，降低了对病原微生物的作用浓度。如蛋白质能消耗大量的酸性或碱性消毒剂；阳离子表面活性剂等易被脂肪、磷脂类有机物所溶解吸收。因此，在消毒前要先清洁再消毒。当然，各种消毒剂受有机物影响程度有所不同。在有机物存在的情况下，氯制剂消毒效果显著降低；季铵盐类、过氧化物类等消毒作用也明显地受有机物影响；但烷基化类、戊二醛类及碘伏类消毒剂则受有机物影响就比较小些。对大多数消毒剂来说，当有有机物影响时，需要适当加大处理剂量或延长作用时间。
（10）微生物的类型和数量
不同类型的微生物对消毒剂的敏感性不同，而且每种消毒剂有各自的特点，因此消毒时应根据具体情况科学地选用消毒剂。
本回答被提问者采纳详情影响消毒药物消毒效果的因素主要有以下几个方面：
（1）搭配不科学合理及浓度不合适
良好的配方能显著提高消毒的效果，例如，季铵盐类消毒剂用70%乙醇配制比用水配制穿透力更强，杀菌效果更好；戊二醛和环氧乙烷联合应用，二者具有协同效应，可提高消毒效力；另外，使用具有杀菌作用的溶剂，例如甲醇、丙二醇等配制消毒液时，常可增强消毒效果。当然消毒药之间也会产生拮抗作用，如酚类（石炭酸、复合酚等）不宜与碱类消毒剂混合，阳离子表面活性剂不宜与阴离子表面活性剂（肥皂等）及碱类物质混合，因此消毒药不能随意混合使用。
（2）温度、酸碱度（pH）等外界环境因素对消毒剂的效果也有影响
消毒现场通常会遇到各种有机物，如分泌物、脓液、饲料残渣及粪便等，这些有机物的存在不仅能阻碍消毒药直接与病原微生物接触，还能中和并吸附部分药物，使消毒作用减弱。因此在消毒药物使用前，应进行充分的机械性清扫，清除消毒物品表面的有机物，使消毒药能够充分发挥作用。不同的消毒剂受有机物影响程度也有所不同，氯制剂消毒效果降低幅度大，季铵盐类、过氧化物类等消毒作用降低明显，戊二醛类及碘伏类消毒剂受有机物影响较小。
（3）消毒的作用时间
一般情况下，消毒剂与微生物接触后，要经过一定时间后才能杀死病原，所以消毒后不要很快进行清扫。作用时间若太短，往往会达不到消毒的目的。另外畜群进行饮水免疫时不能进行饮水消毒和饮水工具的消毒。
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