过去，面对过敏困扰，只能用抗组织胺或类固醇药物来抑制发炎反应，也就是说只能控制过敏症状，有吃药就缓解，一停药症状又出现，无止尽的吃药，病人便会开始担心──会不会吃出问题来？
近几年来，免疫学界经过许多的科学研究发现，吃下一些对人体有益的细菌，可以改善过敏疾病患者的免疫系统，又不会有像药物般的副作用，因此近来「益生菌抗过敏」的观念相当盛行，成为过敏患者争相讨论的话题。
问题就出在免疫系统会发生过敏疾病，其实是与人体的免疫系统有相当大的关系。
健康人的免疫系统有两种路径──Th1及Th2，这两种路径必须平衡发展，如果Th2的免疫路径太活跃，就会过敏。简单来说，益生菌抗过敏的原理就是使Th1上升产生调整型T细胞，并抑制Th2。
目前西药如抗组织胺抑制发炎反应的作用效果快，对于症状的急性处理较佳，但由于其无法抑制Th2，只要停药，症状又会出现。长期要达到抑制Th2，就可以透过益生菌来调整。
那么，以益生菌调整可以使过敏疾病断根吗？许清祥表示，由于过敏疾病50%是基因遗传而来，所以不论任何的治疗都只能有缓解的作用，但服用有效的益生菌缓解过敏是显著的。
许清祥说，如果选用正确的益生菌，1个月可以减轻50%的过敏症状第3个月IgE抗体（引发过敏的抗体）可以下降25%，到了第6个月，体内优势菌丛可以被建立。第6个月之后，素食者就不需再补充了，但习惯大鱼大肉者，仍建议3～7天补充一次，以维持体内益菌的菌量。
选对好菌 才有效果
什么叫做益生菌？许清祥表示，益生菌就是长久以来与人类共生的肠内细菌，这些细菌不会使人生病，反而能带给人类许多的益处，例如乳酸菌、双歧杆菌及少数的链球菌，不同的菌种对人体会有不同的功能，像是帮助营养吸收平衡肠内菌相、改善腹泻帮助乳糖代谢，改善乳糖不耐症改善便秘等。至于可以改善过敏性疾病的益生菌，许清祥和他的研究团队则是花了多年的时间利用先进的生物芯片技术，筛选分离自国人肠道的益生菌，成功研发了适合国人的第一株抗过敏的益生菌，目前市面上几种改善过敏的益生菌产品都是源自这一株，产品型态包括酸奶、胶囊、粉末等。
抗过敏益生菌的发现
近几年来，免疫学界经过许多的关于过敏科学的研讨发现，过敏性疾病或过敏体质的人若是吃下一些对人体有利的细菌，能够改进过敏体质人的免疫体系，又不会产生任何的副作用，益生菌抗过敏调整过敏体质的观念在国际上已适当盛行。
科学家以为：
有过敏体质的人当外来物质或生物体影响免疫体系发作免疫球蛋（IgE）
数量过多，使其释放出一种叫组织胺的物质然后引发过敏表现。抗过敏益生菌可产生有机酸、游离脂肪酸、过氧化氢、细菌素等从而抑制其它有害菌的成长；经过“生物夺氧”使需氧型致病菌大幅度下降，益生菌能够定殖于粘膜、肌肤等外表或细胞之间构成生物屏障，这些屏障能够阻碍病原微生物的定殖，起着占位、抢夺养分、互利共生或对抗效果。并能够影响机体的非特异性免疫功用，进而天然杀伤(NK)细胞的活性，增强免疫球蛋白IgA的排泄，改进皮肤外表或细胞之间构成的的屏障功用。
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