目前，我国绝大多数养殖场的鸡群都存在着支原体的感染，在正常情况下，一般不出现明显的临床症状，一旦有不利因素的应激，就会暴发本病，尤其是大型养殖场温度、湿度、通风控制不当，农户小型养殖场设备简陋、饲养条件差更易发病，如有大肠杆菌、非典型新城疫继发或并发感染，病情则会加重。
（1）临床症状
病鸡表现呼吸道感染，出现咳嗽、喷嚏、气管啰音症状，常伴有鼻涕堵塞鼻孔，频频甩头现象，个别鸡只眼内有泡沫分泌物。
（2）剖检变化
剖检主要病变在呼吸道，气管内黏液较多，鼻腔黏膜潮红、发炎，有时可见气囊内有泡沫样或干酪样物。如继发大肠杆菌感染，则表现为肝周炎、心包炎等；如继发非典型新城疫，则表现为腺胃乳头轻微肿胀，以及肠道淋巴滤泡肿胀、出血等。
（3）类症鉴别
①支原体病与传染性鼻炎的区别：鼻炎发病时面部肿胀，流鼻液、流泪等症状与支原体病相似，但鼻炎发病率高，传播速度快，且剖检通常见不到气囊病变及气管啰音。
②支原体病与传染性支气管炎的区别：鸡传染性支气管炎为病毒性疾病，鸡群发病较急，幼雏常伴有肾脏病变，成年鸡产蛋量大幅度下降并出现畸形蛋，各种抗菌药物治疗无效。
③支原体病与喉气管炎的区别：鸡传染性喉气管炎为病毒性疾病，全群鸡发病急，严重呼吸困难，咳出带血的黏液，很快出现死亡，各种抗菌药均无直接疗效。
④支原体病与维生素A缺乏症的区别：维生素A缺乏症表现眼中蓄积白色豆腐渣样渗出物，不发黄，食管、嗉囊等黏膜上有许多白色小结节，腿脚褪色，抗生素治疗无效，而且鱼肝油治疗效果很好。
⑤支原体病与新城疫的区别：新城疫表现全群鸡急性发病，症状明显，虽然呼吸道症状与慢性呼吸道病相似，但消化道出血严重，并且会出现神经症状，易与慢性呼吸道病区别。鸡新城疫可诱发慢性呼吸道病，而且其严重病症会掩盖慢性呼吸道病，往往是新城疫症状消失后，慢性呼吸道病的症状才逐渐显示出来。