首先，两者最大的区别便是，笛子是需要笛膜才可以吹奏的，而萧的结构则不需要膜，可直接吹奏。
其次，现在流行的两者也有区别，现在市面上流行的笛子多是6孔笛子，而萧则有6、7、8孔萧，本人用的是8孔的。
第三，两者的音质有很大区别，笛子声音清脆悦耳，萧的声音则相对来说要低沉浑厚一些。
第四，哈哈，最为明显的就是，萧明显比笛子要长很多嘛。
学习的话，其实中国的管乐器都有一些共通之处，往往是学会了这个再学那个便方便许多了，我最开始学的是笛子，所以后来学葫芦丝和萧的时候要方便一些了，相对来说，笛子对我要简单一些，当然，葫芦丝更简单。但是我更喜欢萧。
传统的笛子，竹制，有六个按音孔，也有十孔笛，一个吹孔和一个膜孔。吹奏时，由竹管内空气柱的震动而发音。而常用音域有两个八度。如今竹笛又分为C调笛、D调笛、E调笛、F调笛、G调笛（又称梆笛）、A调笛、B调笛，音色由低沉到尖细
笛音清脆、高亢、透明而圆润，独奏、合奏均具特色，表现力丰富，故深受人们喜爱。笛子种类主要分两种，因为这两种笛子分别为昆曲和梆子戏的主要伴奏乐器，所以习惯上称为「曲笛」和「梆笛」。
竹笛的音域局限为三组，如今一般只能吹出二组半。笛子音域增宽可是一件全方位的事，它包括吹孔的形状和大小、各音孔的恰当位置和指法组合，口风力度，以及膜孔的合适位置等。一般来说，膜孔的大小适中、位置略微接近吹孔一端，音域就宽，否则音域就窄。