（1）实用性和全局性原则
系统建设要尽可能满足农业地质环境调查及成果数据管理的需要，为农业地质环境提供信息查询和辅助决策支持，实现农业地质环境管理的科学化、信息化、自动化。并考虑全局（浙江省农业地质环境调查）信息资源（硬件、软件、网络和数据）的共享，使系统在管理与决策中能真正地发挥作用，从而进一步提高管理与决策的效率、质量和水平。
（2）先进性和成熟性原则
系统建设要尽可能采用最先进的技术、方法、软件、硬件和网络平台，同时尽量采用成熟的、可靠的技术。系统在满足全局性与整体性要求的同时，能够适应未来技术发展和需求的变化，使系统能够可持续发展。
（3）标准化和规范性原则
系统要严格按照国家、地方和行业的有关标准规范进行建设，如空间数据分层与编码标准、数据质量与元数据标准、公文标准等，并适当考虑与国际接轨。在没有现成标准规范的情况下，要参照国家、地方和行业的相关标准与规范，制订相应的标准与规范。系统的分析、设计、实现和测试要严格按照软件工程标准规范。
（4）开放性和扩展性原则
为了确保系统的可持续发展，系统应考虑其开放性和扩展性。当业务流程变更时，能较方便地进行系统流程和功能的调整，以适应系统需求变化；系统能够方便地进行管理与维护，软、硬件的升级不影响正常运行，系统功能、结构，以及数据库可方便地扩展；系统要考虑目前的数据交流和将来的数据扩展，系统在输入、输出方面应具有较强的兼容性，能进行各种不同数据格式的转换。
（5）可靠性和安全性原则
数据库中的所有数据应准确、可靠，具有很强的容错能力和处理突发事件的能力，保证网络环境下数据的安全，防止病毒感染、非法入侵、恶意更改毁坏，采取完备的数据保护和备份机制。为了防止非授权用户的非法入侵和授权用户的越权使用，系统应进行分级权限控制，并具备审核功能，自动记录用户访问的情况和操作过程，以备日后查询。
（6）高性能和稳定性原则
系统在设计、开发和应用时，应从系统结构、技术措施、软硬件平台、技术服务和维护响应能力等方面综合考虑，确保系统有较高的性能，如在网络环境下对空间图形的多用户并发操作要具有较高的稳定性和响应速度，综合考虑并确保系统应用中最低的故障率，实现系统良好地运行。