选择在避光、阴凉的地方贮藏，注意通风，通气，控制存储地点的温度。在5℃的低温下，相对湿度90%的环境中贮存可延长果实采后保鲜期限。
经过高锰酸钾溶液（0.2%）处理，可以延长果实贮存时间40天，在采后期间内，贮藏病害主要有砖红镰刀菌、黑曲霉和黄曲霉，经过苯菌灵和氯氧化铜这两种杀菌剂的混合处理可以有效地将这些病害控制住。
在25-30℃的常温状态下，保鲜保质期可超过2周。在果实尚未完全成熟时采摘的火龙果经10-20℃的环境下贮存后，其含糖和含酸量，口感均不及新鲜采摘的火龙果，但前者在贮存期内的物理变化极小，贮存期限可因此而延长。