一是光学显微镜观察到的显微结构，二是电子显微镜观察到的亚显微结构
光学显微镜由于受放大倍数和分辨率的限制，观察到细胞中的结构比较局限，可以看到细胞核、叶绿体、液泡等较大的结构的基本形态。
电子显微镜可以观察到更加细致的结构，如线粒体等细胞器的内部结构，细胞膜的大体结构等方面。
都是用来观察细胞组织的细微结构。不同之处：普通光学显微镜分辨率低（0.2微米），放大率低（ 2000 ），不能分析化学成分。电子显微镜分辨率0.1～0.2纳米，放大率几万~上百万，能分析化学成分
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