徽章由蛇杖、长城、树叶及中国地图几部分组成。
蛇杖来自古希腊神话，据说古希腊医神持蛇杖云游行医救治众人，又传蛇咬死了人，古希腊神嘱咐铸一青铜蛇于杖上，持杖行走可避蛇咬，故西医以蛇杖为医护之标志。树叶可意指中草药，寓意传统中医，两者结合，即中西医结合，筑起医学长城，保护中华大地百姓健康。
原卫生部的标志并不是蛇与剑，而是“蛇绕拐杖”（也叫蛇杖或蛇徽），作为医学标记，神杖表示为人治病之意，灵蛇则是健康长寿的象征。
希腊是蛇徽的发源地，从古到今，蛇徽遍布希腊各地。到了近代，美国、英国、加拿大、德国以及联合国世界卫生组织都用蛇徽作为自己的医学标志。50年代前中国中华医学会的会徽上也有蛇徽。1948年4月出版的《中华医学杂志》，封面就一个赫然醒目的蛇徽。
中国卫生组织的标志是由一条蛇盘绕的权杖所覆盖的联合国标志组成。长期以来，由蛇盘绕的权杖系医学及医学界的标志。
背景图案为中国地图，寓意卫生部的工作范围遍及全国，为全国人民的健康服务；经纬线寓是世界医药卫生事业的组成部分。中心外围图案的长城是中国的象征，同时体现了预防为主的卫生工作方针，标志着卫生工作是保护人民健康的坚固长城。橄榄枝代表良好的生态环境，象征生命、健康和平。外圈图案是中华人民共和国卫生部的中英文。
中国卫生组织标志会微由一条蛇盘绕的权杖所覆盖的联合国标志组成。蛇绕权杖系医学及医学界的标志。权杖表示云游四方，为人治病之意，灵蛇侧是健康长寿的象征。