从基因上来看
蓝玫瑰是转基因花卉品种。科学家通过基因工程技术将其他花卉的一种可以产生蓝色素的基因转移到月季中，导致这种新品种月季产生大量蓝色素，使其花朵非常自然地呈蓝色。花瓣的蓝色是可以遗传的。蓝色妖姬是一种人造花，通常是由厂家和花店将其他苍白的蔷薇科花卉染成蓝色而成，并无基因变化。花的蓝色是不能遗传的。
从生产方式来看
蓝玫瑰的生产主要来自种植。在农业上，引入纯转基因品系进行种植，成熟后收获种子进行大量繁殖。蓝色妖姬的制作方法和蓝色玫瑰大不相同。或者工厂花店通过采购白色或粉色玫瑰或玫瑰直接给花染色。
从颜色上看
蓝玫瑰的蓝色非常自然，鲜艳细腻，不易褪色。蓝色妖姬的蓝色与着色剂的种类密切相关。不同厂家生产的蓝色妖姬颜色差别很大，有的是很淡的蓝色，有的甚至是深蓝色。这种染蓝不仅颜色不自然，而且容易褪色。
从作用上看
蓝玫瑰不仅可以作为制药原料生产治疗月经不调、痛经等疾病的药物，还可以用来提炼植物精油。从其花瓣中提取的油芳香宜人，可用于制作视频或化妆品。除了两者的观赏功能，蓝色妖姬基本没有其他功能。但蓝色妖姬作为玫瑰界长久以来的宠儿，有着自己独特的人文价值，代表着恋人之间的纯真爱情。时至今日，
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