不会。二级建造师证书是考生通过考试取得，是不会自动注销的，但是二级建造师证书注册是有效期的，每一注册有效期为3年，注册有效期满需要进行延续注册。
二级建造师证书是长期有效的，不用也不会注销，但是二建证书注册是有期限的，二级建造师每一注册有效期内都需要进行继续教育，注册有效期满需要延续注册，如果不延续注册的话，那么注册证书失效，但是资格证书不会失效。
二级建造师注册条件：
取得资格证书的人员应当受聘于一个具有建设工程勘察、设计、施工、监理、招标代理、造价咨询等一项或者多项资质的单位，经注册后方可从事相应的执业活动。担任施工单位项目负责人的，应当受聘并注册于一个具有施工资质的企业。
二级建造师证书延续注册：
注册有效期满需继续执业的，应当在注册有效期届满30日前，申请延续注册。延续注册的，有效期为3年。
申请延续注册的，应当提交下列材料：
(一)注册建造师延续注册申请表;
(二)原注册证书;
(三)申请人与聘用单位签订的聘用劳动合同复印件或其他有效证明文件;
(四)申请人注册有效期内达到继续教育要求的证明材料。
申请人有下列情形之一的，不予注册：
(一)不具有完全民事行为能力的;
(二)申请在两个或者两个以上单位注册的;
(三)未达到注册建造师继续教育要求的;
(四)受到刑事处罚，刑事处罚尚未执行完毕的;
(五)因执业活动受到刑事处罚，自刑事处罚执行完毕之日起至申请注册之日止不满5年的;
(六)因前项规定以外的原因受到刑事处罚，自处罚决定之日起至申请注册之日止不满3年的;
(七)被吊销注册证书，自处罚决定之日起至申请注册之日止不满2年的;
(八)在申请注册之日前3年内担任项目经理期间，所负责项目发生过重大质量和安全事故的;
(九)申请人的聘用单位不符合注册单位要求的;
(十)年龄超过65周岁的;
(十一)法律、法规规定不予注册的其他情形。
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