员工自离公司应当支付劳动者应得的工资，不得拖欠和克扣劳动者的工资。
根据《工资支付暂行规定》第九条 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
第十八条 各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。
经济补偿和赔偿金的标准，按国家有关规定执行。
扩展资料：
《劳动保障监察条例》第二十六条 用人单位有下列行为之一的，由劳动保障行政部门分别责令限期支付劳动者的工资报酬、劳动者工资低于当地最低工资标准的差额或者解除劳动合同的经济补偿；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50%以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的；
（二）支付劳动者的工资低于当地最低工资标准的；
（三）解除劳动合同未依法给予劳动者经济补偿的。
参考资料来源：百度百科——工资支付暂行规定
根据合同法规定，员工自离公司是不发工资的，是属于属于违法解除合同。
自离，自动离职，指劳动者根据用人单位和自身情况擅自离职，而强行解除与用人单位的劳动关系的一种行为。因辞职或要求解除合同未准，擅自离职或违约出走；未说明原因不辞而别；受优厚待遇诱惑擅自“跳槽”等均属自动离职。
1、属于违法解除合同，按照《劳动合同法》第九十条规定，对用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。用人单位要求劳动者赔偿损失的，应当承担举证责任。
2、根据劳动部《工资支付暂行规定》第九条规定，用人单位均应在解除合同之时一次性结清工资。赔偿损失与结清工资是不同是不同的法律关系，二者应当分别计算，合并结算。
3、《劳动合同法》第九十条 劳动者违反本法规定 解除劳动合 同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
4、劳动部《工资支付暂行规定》劳部发〔1994〕489号第九条 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
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