直接原因：组成蛋白质的
氨基酸的种类、数目、排列顺序不同,形成的肽链的盘曲折叠方式及形成蛋白质的空间结构千差万别。
根本原因：由于基因组成的多样性，基因控制着蛋白质的多样性。
对
蛋白质结构进行分类的方法有多种，有多个结构数据库（包括SCOP、CATH和FSSP）分别采用不同的方法进行结构分类。存放蛋白质结构的PDB数据库中就引用了SCOP的分类。对于大多数已分类的蛋白质结构来说，SCOP、CATH和FSSP的分类是相同的，但在一些结构中还有所区别。
扩展资料：
蛋白质的分子结构可划分为四级，以描述其不同的方面：
一级结构：组成蛋白质多肽链的线性氨基酸序列。
二级结构：依靠不同氨基酸之间的C=O和N-H基团间的氢键形成的稳定结构，主要为α螺旋和β折叠。
三级结构：通过多个二级结构元素在
三维空间的排列所形成的一个蛋白质分子的三维结构。
四级结构：用于描述由不同多肽链（亚基）间相互作用形成具有功能的蛋白质复合物分子。
蛋白质按照功能分类：
1、结构蛋白质：角蛋白，
胶原蛋白，弹性蛋白。
2、有生物活性的蛋白质：酶，激素，
免疫球蛋白。
3、食品蛋白质：凡可供食用，易消化，无毒和可供人类利用的蛋白质。
参考资料：
搜狗百科-蛋白质结构