生物信息学顾名思义是生物学+信息技术，通常评价一个学科发展的好坏，要看数学和计算机在这个学科中所占的比例。随着技术的发展，现在的生物学研究已经不在如以前主要以实验为主，数学和计算机科学在生物学研究中所占的比重越来越大。基因组学，主要是研究基因组的科学，例如人类基因组计划，从某种意义上来说，基因组学等同于生物信息学。但是随着“组学”的发展，或者说组学这个词的泛滥，出现了“转录组学，蛋白组学，免疫组学，贯穿组学“等等，现在的基因组学往往成为生物信息学的一个分支，它包含在生物信息学中。
刚接触生物学的时候，我对生物信息学的定义感觉也很模糊，只到做毕设的时候才清晰起来。其实“基因组学”和“生物信息学”两个领域，是从不同角度对生物学范畴内一部分知识的各自划定，而划定的规则完全不同。
”基因组学“这个领域的划分，是研究对象”基因组“决定的。因此只要是和基因组相关的知识和研究问题就属于这一范畴，例如我们常常听到的基因组测序、单核苷酸多态性、DNA甲基化和去甲基化等等。
而”生物信息学“这个领域的划分，则是由研究方法”信息学“决定的。因此凡是运用到信息学方法研究的生物学问题都可以算是生物信息学，例如基因组序列分析、RNA和蛋白质结构预测、蛋白质相互作用网络构建和分析等。
所以综上所述，我不是很同意另一个回答”基因组学是生物信息学的一个分支“的说法。我认为更确切的是，有一些用生物信息学的方法来解决的基因组学问题，那么这一些问题就属于两个学科的交集。而两个学科各自有不相交的内容。基因组学中，早期的遗传分析、分子杂交以及现在的DNA化学修饰机制等问题的很多相关研究并不需要借助生物信息学方法。而生物信息学中则有更多的问题不属于基因组学范畴，正如其他答案中举例。至于两个领域的发展前景，我是这么认为的。当代越来越发达的计算机科学和信息学正在快速渗透入基础科学研究的其他领域。作为从遗传学发展而来的基因组学，原本是传统生物学的学科。但是当基因组学发展到想要回答一些宏观的问题，例如涉及全基因组而不是几个DNA分子的问题时，就需要借助信息学方法。其他的基础学科也面临着这样的技术革命。我想题主提出这个问题，可能也是信息学全面渗透入基因组学的一个体现。
