法律分析：申请宠物食品生产许可证，需要在申请人所在地县级以上地方市场监督管理部门办理。
法律依据：《食品生产许可管理办法》
第十三条 申请食品生产许可，应当向申请人所在地县级以上地方市场监督管理部门提交下列材料：
（一）食品生产许可申请书；
（二）食品生产设备布局图和食品生产工艺流程图；
（三）食品生产主要设备、设施清单；
（四）专职或者兼职的食品安全专业技术人员、食品安全管理人员信息和食品安全管理制度。
第十九条 县级以上地方市场监督管理部门对申请人提出的食品生产许可申请，应当根据下列情况分别作出处理：
（一）申请事项依法不需要取得食品生产许可的，应当即时告知申请人不受理；
（二）申请事项依法不属于市场监督管理部门职权范围的，应当即时作出不予受理的决定，并告知申请人向有关行政机关申请；
（三）申请材料存在可以当场更正的错误的，应当允许申请人当场更正，由申请人在更正处签名或者盖章，注明更正日期；
（四）申请材料不齐全或者不符合法定形式的，应当当场或者在5个工作日内一次告知申请人需要补正的全部内容。当场告知的，应当将申请材料退回申请人；在5个工作日内告知的，应当收取申请材料并出具收到申请材料的凭据。逾期不告知的，自收到申请材料之日起即为受理；
（五）申请材料齐全、符合法定形式，或者申请人按照要求提交全部补正材料的，应当受理食品生产许可申请。