中国农业发展银行在机构设置上实行总行、一级分行、二级分行、支行制；在管理上实行总行一级法人制，总行行长为法定代表人；系统内实行垂直领导的管理体制，各分支机构在总行授权范围内依法依规开展业务经营活动。
中国农业发展银行总行设在北京。其分支机构按照开展农业政策性金融业务的需要，并经银监会批准设置。截止2008年12月31日，我行共有各级各类机构2151个，其中，总行1个，总行营业部1个，省级分行30个、省级分行营业部30个、地（市）分行302个、地（市）分行营业部193个、县级支行1594个（含县级办事处3个）。
中国农业发展银行系统现有员工约5.9万人。 分行名称 地址 邮编 北京市分行 北京市西城区月坛北街甲2号 100045 天津市分行 天津市河西区宾水道11号 300061 河北省分行 石家庄市中华南大街216号 050056 山西省分行 太原市康乐街38号 030001 内蒙古自治区分行 呼和浩特市赛罕区新华东街80号 010010 辽宁省分行 沈阳市沈河区惠工街209号 110013 吉林省分行 长春市解放大路2733号 130061 黑龙江省分行 哈尔滨市道里区尚志大街141号 150010 上海市分行 上海市延安东路45号 200002 江苏省分行 南京市汉中路120号青华大厦 210029 浙江省分行 杭州市下城区建国北路283号 310003 安徽省分行 合肥市金寨路126号 230022 福建省分行 福州市鼓楼区树汤路19号 350003 江西省分行 南昌市子安路26号 330025 山东省分行 济南市经十路140号 250002 河南省分行 郑州市红旗路81号 450008 湖北省分行 武汉市武昌区中北路215号 430077 湖南省分行 长沙市劳动西路329号 410015 广东省分行 广州市越秀区解放北路928号 510040 广西壮族自治区分行 南宁市民族大道96号 530022 海南省分行 海口市国贸路65号 570125 重庆市分行 重庆市渝中区公园路1号 400010 四川省分行 成都市均隆街63号 610061 贵州省分行 贵阳市神奇路32号 550002 云南省分行 昆明市护国路66号 650021 陕西省分行 西安市西五路91号 710004 甘肃省分行 兰州市城关区张掖路82号 730030 青海省分行 西宁市城中区南关街57号 810000 宁夏回族自治区分行 银川市文化东街1号 750004 新疆维吾尔自治区分行 乌鲁木齐市人民路193号 830004
