区境最早的小学是清咸丰十一年（1861年）在引翔港镇创办的厚仁义学，光绪三十一年（1905年）改为厚仁初级小学堂。最早的中学是光绪三十二年创办的上海浸会大学预科。
建国前，教育事业十分落后，学校少，设备简陋。据民国35年（1946年）统计，原杨树浦区文盲率达50.59%，学龄青少年儿童失学率达48.80%。建国初，杨树浦、榆林两区共有中学生3205人，小学生20251人，在园幼儿842人，共23694人，占总人口的6.46%。中小学教职工仅有1132人。
建国后，首先接管公立中小学，对私校加强管理，重点整顿。人民政府坚持“教育为工农业生产服务，为工农服务”的方向，实行减免费和人民助学金制度，大力发展儿童晚班。1957年后，贯彻“两条腿走路”的办学方针，公办、民办并举，广泛调动了工厂、企业、社会团体及群众办学的积极性，中小学教育事业得到了迅速发展。“文化大革命”期间，大批干部和教师横遭批斗，备受迫害，校舍和设备毁坏，教育事业损失惨重。
粉碎江青反革命集团后，特别是1978年以来，教育事业重新得到发展。1990年，全区有中学53所，学生35021人（包括职业班1200人），教职工7223人；小学106所，学生78204人，教职工5359人；幼儿园298所，幼儿40216人，教职工5203人。在校中小学生、幼儿共153441人，占总人口13.65%，比建国初增加5.48倍。中小学幼儿园教职工共17785人，比建国初增加14.71倍。
由于重视师资队伍的建设，加强基础，狠抓薄弱环节，开展教学科研，优化课堂教学，教育质量有了显著提高。1989年9月，国家教委授予“全国幼儿教育先进区”的称号；小学毕业生合格率连续稳定在99%以上，优秀率达88%左右；初中毕业生合格率自1984年的56.65%上升到1990年的98.38%；高中毕业生录取率自1985年的47.68%上升到1990年的75.54%。处于全市先进行列。
成人教育最早创办的是民国2年（1913年）的通俗学校和民国5年的恒丰纱厂职工补习学校。中国共产党诞生后，有民国13年的杨树浦平民学校与民国14年的思恩义务学校等，均有中共地下党团活动。
建国后，成人教育发展迅速。1954年，初等教育计有市立工技、产业区校、厂校共57所。至1960年3月，共扫除文盲45763人。1981年，全区已有中等业余学校39所，学员达22486人。1988～1990年，区属职工76734人参加岗位培训，占职工总数的88.8%。成人高等教育也有很大发展，1990年境内有成人高校220所。
建国后，中等职业技术教育得到迅速发展，1990年，共有中等专业学校15所，职业学校4所，中等技术学校64所。
境内最早的大学是上海浸会大学，创办于光绪三十二年（1906年），光绪三十三年自四川路迁至区内军工路，民国3年定名沪江大学。迄解放时，境内共有高等学校9所，通过1952年院系调整后，存有4所，后又陆续新建、迁入11所。1990年，境内共有全日制高等学校15所，占全市近1/3。
杨浦知识创新区在空间上覆盖区域全境，以“三区联动”为发展的指导方针进行合作、互动。“大学的城市、城市的大学”——根据区域内高校的分布状况，高校校区规划为西区、东区和北区三个区域，西区规划以复旦大学、同济大学、财经大学等为核心；东区规划以上海理工大学、上海海洋大学为核心；北区规划以中国人民解放军第二军医大学、上海体育学院为核心。另外复旦附中、交大附中、控江中学、杨浦高级中学、同济大学第一附属中学、上海理工大学附中、市东中学、上财附中等上海市名牌高中也云集杨浦。因而杨浦被称为上海的“学术区”，在教育质量方面具有相当优势。
