为力保鲜食的鲜度并避免发生缺货的状况，通常一天进货三次，而且在食品赏味期限前数个小时，便会撤下卖剩的商品。这些鲜食原本都被当作可燃垃圾，送到当地的垃圾焚化炉或掩埋场处理。近年来因为资源再生运动普及，便利商店也纷纷着手鲜食废弃物再生利用的研究。 知名连锁便利商店LAWSON自一九九七年首先树立典范，在神奈川县内二百多家连锁店实施过期鲜食循环加工再生实验。LAWSON每一家连锁店平均每天产生八公斤食品废弃物，相当于普通家庭的十天份量。这些食品废弃物经由废弃物处理商送到堆肥处理工厂加工后，再出货到肥料公司。 肥料公司再加入鸡粪等材料，把堆肥加工成有机肥料后，最后由LAWSON分发给契约农户。契约农户利用这些肥料所生产的蔬菜，则送到LAWSON的便当工厂，化身为生菜沙拉或便当内的菜肴。目前，全国店铺总计八百五十多家LAWSON连锁店，都已加入这个循环加工再生系统。 FamilyMart（全家便利商店）则是自一九九九年四月开始，在三重县内约五十家连锁店，实施与LAWSON类似的鲜品肥料系统实验。7- Eleven则从一九九八年一月开始，在北海道札幌市内实施家畜饲料化实验。他们的计划是打算将各家连锁店的鲜品废弃物，加工成猪饲料，贩卖给畜产农户。畜产农户再将饲养的猪，卖给7-Eleven便当工厂当炸猪排便当等原料，而猪的粪尿则可加工成有机肥料，分发给契约农户培育有机蔬菜。 一般来讲，再生系统必须收集广大范围的鲜品废弃物，并集中于一处加工处理，如此才能收支相抵。但是，由于日本的食品废弃物法律规定，各个地方自治单位的食品废弃物不可擅自搬出境外，因此规模较小的便利商店若想在自治单位内实施再生事业，其实很不划算。 此外，这类食品再生场通常会发出恶臭，而且比一般垃圾处理设施还严重，因此即便能够说服自治单位将食品废弃物搬出境外，也往往很难找得到同意让食品废弃物移入境内的自治单位。就算是已经在全日本开展再生系统的LAWSON，也承认这的确是最棘手的问题。 唯一百分之百成功的例子，是管理兼经营玉川高岛屋购物中心的东神开发公司。东神开发公司自一九九二年开始，便已着手食品废弃物处理问题。购物中心内有将近百家餐厅与食品店，每年的食品废弃物多达一千吨，据说，当初光是委托东京都处理食品垃圾的费用，便需要三千万日圆左右。虽然初期投资花了七千三百万日圆，每年营运成本也要二千五百万日圆，但是经过十几年，那些食品废弃物有不但九○％都能够再生使用，并且也已达到收支相抵的目标了。 他们的做法是在地下停车场设置大型食品垃圾处理机，先加入微生物，让食品废弃物发酵，再进行温风干燥处理。待废弃物的份量减少到十分之一时，再送到群马县的肥料工厂制成有机肥，最后成为购物中心内赏叶植物的肥料，也成为一般园艺商店的商品。 「垃圾」一直是行政单位最头痛的问题，也是居民切身的民生问题，不过，日本在这方确实处理得不错。
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