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当前搜索:
NCBI怎么查找氨基酸序列
请教:
怎么
用
NCBI查询
新城疫病毒F基因的蛋白质序列、
氨基酸序列
和核苷酸...
答:
核苷酸序列:这个基因网页上,有一项Genomic regions, transcripts, and products。单击那个NC_002617.1(这个是此gene所在的染色体区域),会有两个nucleotide选项,选择FASTA,就连接到
NCBI
sequence viewer,显示整个gene的序列。
氨基酸序列
:还是这个基因网页,底部有一个NP_071469.1, 点击进去连接到蛋白质...
如何查询
任一蛋白质的
氨基酸序列
。
答:
百度查询NCBI,出来的第一条就是。
打开NCBI主页后,在左上角“all databases”下拉菜单中选择“protein”,然后在后面的输入框中输入蛋白的英文名称
。(蛋白英文名称你可以百度它的中文名,一般在百科里可以找到它的英文名,及亚基数量等。)输入完成后,点“search“,会出来一些搜索结果,是同一类蛋白不...
在NCBI中如何查询
基因的功能
答:
知道了基因的名字,在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果,然后点击进去
,有个“MIM”(在线孟德尔遗传)就可以看到它的功能。ORF是开放阅读框,指的是mRNA上编码氨基酸的那段序列,从AUG开始,直到终止子,但是不包括终止子。ORF的数据在进入NCBI主页的右下侧一个叫ORFfinder的超链接里,点击进去后输入...
如何
通过NCDS
序列
??急
答:
当你需要在NCBI Nucleotide数据库中查找特定基因时,
首先输入你要研究的基因名称,进行查询
。在搜索结果中,你会看到"编码"(CDS)这一项,点击后,下方展示的核酸序列部分,便是该基因转录成蛋白质的实际编码部分。这个编码区域直接决定了蛋白质的氨基酸序列,是理解基因功能的关键部分。因此,通过解读CDS序...
怎么
用
NCBI查询
FeSOD基因的蛋白质序列、
氨基酸序列
和核苷酸序列呢?
答:
直接把这个基因进行查询
,在不同的模块下就有不同的信息:比如在Gene数据库就会显示geneID,染色体位置信息等。在Nucleotido中就可查到对应的核苷酸序列。其实你任意点进去一个,在仔细找里面的链接也OK。
NCBI
基因及启动子
序列查找
答:
当已知基因名或ID时,可通过
NCBI搜索
基因序列。首先登陆NCBI官网,在下拉菜单选择gene,搜索基因名或ID。NCBI: https://www.
ncbi
.nlm.nih.gov/ 这里选取一个调节根系发育的基因AT5G61350进行示例。在生物信息学中,FASTA格式(又称为Pearson格式)是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或
氨基酸序列
的格式...
如何查询序列
前后是否有
氨基酸
翻译区
答:
以下是一些常用的工具和方法:1、
NCBI
BLAST:使用NCBIBLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)可以比对
序列
与数据库中已知的蛋白质序列,从而确定序列前后是否有
氨基酸
翻译区。在BLAST的结果中,可以查看序列与数据库中蛋白质序列的比对情况,以及比对的位置和得分等信息。2、ExPASyTranslate:ExPASyTranslate是一个...
如何在ncbi
中
查找
基因cds
答:
进行CDS分析,首先要有一段
氨基酸序列
(基因序列要转换成氨基酸序列),
在NCBI
首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的Specialized BLAST里的第三个链接(Find conserved domains in your sequence (cds))就是CDS分析,输入你的氨基酸序列,就会显示相应的结果。
NCBI如何
下载蛋白质的核酸
序列
答:
首先登录
NCBI
网站,选取下拉条中的Nucleotide,输入你想要
搜索
的内容,找到目标内容后,单击打开,题目下方的一行就是编号;若想要下载核酸
序列
,点击右上角的sent to→Complete Record→File→FASTA,就能下载全部的序列,若是想下载其中一段序列,可对准你想要的序列右击,在新标签页打开,然后步骤同上;若...
求助保守
序列查找
,引物设计
答:
如果:你研究的物种没有这个基因,就可以按下面步骤做。1:把你的基因名称粘贴
在NCBI
的蛋白质数据库中,进行
搜索
(这个比核酸数据库更保守一些)2:根据搜索到的结果,看下面列出的信息,有没有和你研究物种是近缘的(从分类上说的)3:下载10-20条左右的
氨基酸序列
(片段长度最好差不多、下载最好...
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