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当前搜索:
NCBI中蛋白氨基酸序列怎么看
请教:
怎么
用
NCBI
查询新城疫病毒F基因
的蛋白质序列
、
氨基酸序列
和核苷酸...
答:
核苷酸序列:这个基因网页上,有一项Genomic regions, transcripts, and products。单击那个NC_002617.1(这个是此gene所在的染色体区域),会有两个nucleotide选项,选择FASTA,就连接到
NCBI
sequence viewer,显示整个gene的序列。
氨基酸序列
:还是这个基因网页,底部有一个NP_071469.1, 点击进去连接到
蛋白
...
如何
查询任一
蛋白质的氨基酸序列
。
答:
百度查询
NCBI
,出来的第一条就是。打开NCBI主页后,在左上角“all databases”下拉菜单中选择“protein”,然后在后面的输入框中输入
蛋白的
英文名称。(蛋白英文名称你可以百度它的中文名,一般在百科里可以找到它的英文名,及亚基数量等。)输入完成后,点“search“,会出来一些搜索结果,是同一类蛋白不...
如何
通过NCDS
序列
??急
答:
当你需要
在NCBI
Nucleotide数据库中查找特定基因时,首先输入你要研究的基因名称,进行查询。在搜索结果中,你会看到"编码"(CDS)这一项,点击后,下方展示的核酸序列部分,便是该基因转录成蛋白质的实际编码部分。这个编码区域直接决定了
蛋白质的氨基酸序列
,是理解基因功能的关键部分。因此,通过解读CDS序...
怎么
用
NCBI
查询FeSOD基因
的蛋白质序列
、
氨基酸序列
和核苷酸序列呢?
答:
直接把这个基因进行查询,在不同的模块下就有不同的信息:比如在Gene数据库就会显示geneID,染色体位置信息等。在Nucleotido中就可查到对应的核苷酸
序列
。其实你任意点进去一个,在仔细找
里面的
链接也OK。
一直
氨基酸序列
,
如何查看
其
蛋白质
基本性质,及其结构
答:
一、根据自己所掌握的样品物种来源,并将该序列拿到NCBI上去blast一下,如果有相似的序列,则能大概猜测其本质
。二、在心里有个底之后,再把这个序列拿到swiss-model上进行在线的免费同源建模(如果前一步的相似性太低的话,这一步就不要做了,一般认为,同源性至少要超过30%还是20%才有建模的意义)。
在NCBI中如何
查询基因的功能
答:
知道
了基因的名字,在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果,然后点击进去,有个“MIM”(在线孟德尔遗传)就可以看到它的功能。ORF是开放阅读框,指的是mRNA上编码
氨基酸的
那段
序列
,从AUG开始,直到终止子,但是不包括终止子。ORF的数据在进入
NCBI
主页的右下侧一个叫ORFfinder的超链接里,点击进去后输入...
如何
在uniprot数据库中查找某个
蛋白序列
答:
NCBI
下有很多数据库,以下是
蛋白质序列
PopSet 包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列。PopSet既包括核酸序列数据又包括蛋白质序列数据。Entrez 功能强大,在于它的大多数记录可相互链接,既可在同1数据库内链接,也可在数据库之间进行链接。当应用BLAST软件比较某
氨基酸
或DNA序列与库...
如何
查询
序列
前后是否有
氨基酸
翻译区
答:
以下是一些常用的工具和方法:1、
NCBI
BLAST:使用NCBIBLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)可以比对序列与数据库中已知
的蛋白质序列
,从而确定序列前后是否有
氨基酸
翻译区。在BLAST的结果中,可以
查看序列
与数据库
中蛋白质序列
的比对情况,以及比对的位置和得分等信息。2、ExPASyTranslate:ExPASyTranslate是一个...
NCBI
基因及启动子
序列
查找
答:
核苷酸序列:
氨基酸序列
:
查看
fasta,左侧为CDS序列,右侧方框内为序列所在范围,24667873——24670749。通常认为启动子在基因上游2kb范围内,这个基因的方向从左至右,因此启动子范围就在基因左侧起始位置加2kb,24665873——24667872。如果基因方向是从右向左,那么启动子区域就是右侧位置加上2Kb。FASTA格式...
怎样在NCBI上
查找基因的cDNA
序列
答:
在NCBI
主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可。以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和complete cds
序列的
结果都可以,如下 点击进入序列文件
查看
详情,以上图搜索结果18为例,点开后界面如下 向下找到cds标签 点击CDS跳出如下...
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