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测序cds什么意思
解释一下 cDNA、mRNA,EST,
CDS
,transcripts,gene的意义及其之间的关系...
答:
CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语
。参考资料:http://baike.baidu.com/view/212931.htm http://baike.baidu.com/view/548250.htm#
ORF cDNA 和
CDS
的区别
答:
CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列
,是结构基因组学术语 ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断.当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么 CDS与开放读码框ORF的区别 (1)开放读码框是从一个起始密码...
从转录组
测序
结果中得到一基因预测的
CDS
,pcr后测序获得orf的后半段...
答:
你先设计一段前半段的引物看看到底有没有正确的那部分序列吧。。
cds
区
测序
结果与ncbi有几个碱基的突变
答:
最简单的就是拿去
测序 CDS
区完全正确就可以了 验证功能的话就做western 以及检测该基因下游targets的表达量 比如它可以促进A的表达 就转染细胞后检测A的表达量是否上升
uniprot怎么看蛋白序列是通过实验获得的
答:
另外,里面的信息可以看引用文献。5、接下来我们来看看mRNA序列。可以看到序列号、长度、相关文献等。6、为了能看到mRNA上每个区域的划分、外显子、编码区域、氨基酸序列等,会持续下降。7、点击前面的“
CDS
”,最后的序列中就会看到编码靶蛋白质的核酸序列。点击fasta可以下载序列。
genbank如何使用?
答:
GenBank Overview 基本信息 •
什么
是GenBank?GenBank是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(
CDS
)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。• 纪录样本 - 关于GenBank的各个字段的详细描述,以及同...
Sequin提交序列详细步骤
答:
接下来,跳过
测序
技术页面,专注设置序列的位置和遗传密码。选择线粒体或其他特定系统,如
CDS
、rRNA、gene或none。精确输入3'、5'信息,正负链的选择,以及source对话框中的通用或特定限定词。以八棱海棠为例,别忘了添加Tissue-type和cultivar等具体细节。对CDS进行阅读框架设定,确认DNA或mRNA的编码区域...
转录组定量工具-featureCounts安装及使用
答:
-t 指定feature的类型,默认是exon,当然gtf里面还有gene、
CDS
或者直接以feature命名的分类方式。其它参数: -f 参数 该参数设置后统计的是 feature 层面(默认是 exon )的参数,如果不设置则是直接统计 meta-feature 参数(即一个 gene 中的多个 exon )这时按...
基因有三个变体怎么设计过表达质粒
答:
(1)设计
CDS
引物,通过提取组织RNA,并设计相应引物,运用PCR的方法获得目的基因CDS序列,连接到克隆载体后,挑取单克隆进行
测序
。这种方法相对成本较低,但是PCR过程可能引入突变。适合基因CDS序列较短的情况。(2)全基因合成:根据目的基因的CDS序列,直接交给公司设计合成目的基因。此方法优点准确性高,...
未知基因克隆与表达的研究途径
答:
看来是要研究的物种没有
测序
咯 首先根据同源基因比对,然后在保守区域设计间并引物,先将保守区域克隆。然后根据保守区域设计基因特异引物,进行5’RACE及3’RACE,分别拿到保守区域两端的片断,然后序列拼接,拼出全长序列后,在基因两端设计一对引物将基因全长
CDS
克隆。表达策略:1 反向遗传学:克隆的CDS...
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