家兔的选种方法和其他家畜基本一样，要防止片面选择，不可把着眼点只放在个体的体质、外貌和生产力上，还要重视家系和后裔鉴定，考察其传种接代的实际效果。目前生产中较为常用的主要有个体选择和家系选择两种。
（1）个体选择：根据个体本身表型值的高低选留种兔称为个体选择，这种方法简便易行。在一般情况下，当性状遗传力较高、个体本身有这种性能表现时，个体选择效果较好。对于限性性状（如公兔不产仔）和活体上不能度量的性状（如肉兔的屠宰率），个体选择法不适用。
个体选择主要根据体形外貌和生产性能鉴定来进行，对于不同用途的家兔，应有不同的要求重点。肉兔主要选择体形外貌符合品种特征和肉用体形、生长快、育肥时间短、产肉性能好、耗料少、成活率高、繁殖力强的个体留作种用。
种公兔要求种性纯：必须健康无病，生长发育良好，体质健壮，性情活泼，睾丸发育良好，性欲强（可用母兔试情）。生长受阻、单睾、隐睾，或行动迟钝、性欲不强者不能留作种用。种母兔要求奶头数在8个以上，发育匀称、饱满。
种母兔选择重点考查其繁殖性能和母性。如果连续7次拒绝或连续空怀2～3次，连续4胎产活仔数均低于4只的母兔应淘汰，泌乳力不高、母性不好，甚至有食仔癖的母兔不能留作种用。应选受胎率高、产仔多、泌乳力高、仔兔成活率高、母性好的母兔作种用。
还要进行体形外貌鉴定（品种特征、体躯、四肢、被毛等）和生产性能鉴定（体重、体尺、断奶成活率、幼兔成活率、商品兔成活率、繁殖率、受胎率、产肉性能、生长速度、饲料转化率、屠宰率等）。
（2）家系选择：根据家系均值的高低决定留种或淘汰的选择方法称为家系选择。家系选择适用于一些遗传力较低的性状，如繁殖力、泌乳力和成活率等。因为遗传力低的性状，其表现值的好坏，受环境因素的影响较大，如果只根据个体选择准确性较差，采用家系选择法能比较正确地反映家系的基因型，选择效果较好。
家系选择的主要形式有系谱选择，同胞、半同胞测验和后裔鉴定等。
① 系谱选择：系谱是种兔的家谱，有横式系谱、竖式系谱和结构式系谱三种形式。系谱中有祖先的编号及其主要性能。系谱选择就是根据系谱记载资料（如生长发育、生产性能等）进行分析评定、选择的一种方法。按遗传规律，对子代品质影响最大的是亲代（父母代），其次是祖代、曾祖代，离当代愈远的祖先，其遗传影响越小。一般应用系谱选择时，重点考虑2～3代以内的祖先。
② 同胞、半同胞测验：同胞、半同胞主要是指同父同母的全同胞家系和同父异母或同母异父的半同胞家系。采用同胞、半同胞测验进行家系选择所需的时间短、效果好。兔的利用年限较短，采用同胞、半同胞测验的选择方法，在较短时间内就可得出结果，优良的种兔就可留种繁殖，能缩短世代间隔，加快育种进程。进行同胞、半同胞测验时，遗传力越低的性状，同胞、半同胞数越多，测定效果就越好。
③ 后裔鉴定：这是通过对后代性能的评定来判断种兔遗传性能的一种选择方法。一般多用于公兔。具体做法：选择一批外形、年龄、胎次、生产性能基本一致的母兔，在相同的饲养管理条件下，用不同的公兔配种，根据其产仔数、后代的生长发育、饲料转化率、毛皮品质等性能进行综合评定，以判断公兔的种用价值高低，决定是否留作种用。
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