2012年12月6日，广州地铁六号线二期萝岗至香雪段施工期间，路面突然沉降，相关部门迅速进行处理，预计8日中午前交通将恢复。6日上午9点20分左右，广州盾建在盾构隧道施工过程中发现开创大道大塱村路段局部地面下沉，最大沉降量15厘米，项目部立即启动应急预案并上报萝岗区政府。区政府副区长王建新带领多部门领导赶到现场，组织协调路面修复工作。为保障市民安全，广州交通和地铁官方发布微博，提醒市民绕行沉降区域，路面随后封闭，抢修工作紧张进行。
2013年1月28日下午，广州荔湾区康王南路与杉木栏路交界处出现地陷，涉及至少三幢商铺楼倒塌。据广州地铁介绍，中铁七局在施工文化公园站折返隧道时，发现地面下沉，及时疏散了周边人员。地陷区域约100平方米，深10多米，地铁采取了混凝土输送车和搅拌车回填措施防止进一步塌陷。交通受到影响，但幸运的是没有人员伤亡。有消息指出，涉事房屋部分已纳入拆迁计划，多数住户已搬离，这在一定程度上减少了事故中的伤亡可能。
广州地铁六号线西起白云区的金沙洲，向东南穿越荔湾区、越秀区，之后折向东北，经天河区，止于萝岗区。线路大致呈“U”型走向，主要经过大坦沙、珠江北岸、先烈路、广州大道北、燕岭路、广汕路、开创大道。