台州学院医学院以其先进的设施为学生和研究人员提供了优质的教学和科研环境。学院内设有形态学实验室、显微镜互动实验室、机能学实验室、生化实验室、细胞分子生物学实验室、病原生物学与检验实验室等，每个实验室设计精心，注重通风透光，空间宽敞舒适，保持极高的清洁度，为学习和研究工作提供了理想的场所。这些实验室总价值超过1266万元，平均每位学生享有9277元的实验设备投入，充分体现了学院对教学资源的重视。
此外，医学院还拥有强大的临床实践基地，包括一家直属的三级乙等市立医院，以及非直属的三级甲等台州医院和三级乙等台州市中心医院。学院还与复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、浙江大学医学院的浙一医院、浙二医院、邵逸夫医院、儿童医院、妇保医院等40多家知名医院合作，为学生提供了丰富的临床实习和教学机会，让学生能够将理论知识与实际操作紧密结合，提升实践能力。