根据上述职责，市住房和城乡规划建设局设16个内设机构：
（一）办公室。
负责文电、会务、财务、固定资产管理、机要、档案等机关日常工作；承担信息、安全、保密、新闻宣传、信访、督办、建议提案、政务公开、机关作风建设、综合治理等工作；指导和协调局系统电子政务、城市建设档案工作。
（二）政策法规科。
组织起草有关地方性法规、规章草案和规范性文件；承担有关行政处罚、行政复议和行政应诉工作；负责行政许可实施的监督和评估；负责法制宣传教育工作；研究分析住房、城乡规划和建设的重大问题，组织拟订相关政策。
（三）住房保障科。
贯彻落实国家、省、市关于推进城镇住房制度改革的方针、政策和措施并组织实施；拟订住房保障的规划、政策法规并监督执行；负责组织保障性住房的建设；指导监督市属公产房管理工作。
（四）住房发展与房地产市场监管科。
拟订住房和房地产产业发展规划和产业政策，并监督实施；负责房地产开发企业、物业服务企业、房地产评估机构的资质管理及相关从业人员执业资格的管理；负责核发《商品房预售许可证》和预售资金监管工作；指导监督全市物业管理工作。
（五）规划编制管理科。
负责全市城市规划设计的行业管理工作；负责城乡规划测绘管理工作；组织开展城市发展的战略研究；组织编制全市总体规划、城乡近期建设规划、分区规划、控制性详细规划及重要地区修建性详细规划、专项规划；承办市政府委托的规划编制审批工作；综合平衡与城市规划相关的专业规划、专项规划；参与编制区域规划、江河流域规划、海洋利用规划、土地利用规划、土地利用年度计划和年度土地开发供应计划（含农用地转用计划和土地储备计划）；承担市城市规划委员会办公室的日常工作。
（六）建设用地规划管理科。
负责全市大中型建设项目的规划选址工作，负责管辖范围内各类建设项目的规划选址、定点及面积核定工作；核发《建设项目选址意见书》；负责建设用地规划许可，提出规划设计条件，核发《建设用地规划许可证》和《临时建设用地规划许可证》；参与建设用地计划和土地划拨、出让、转让方案的制定；参与大中型项目建设的可行性研究与论证；参与处理违法用地案件。
（七）建筑工程规划管理科。
负责审批修建性详细规划;负责建筑工程、装饰装修工程等设计方案及初步设计的业务管理;负责建筑工程规划许可，负责大中型建筑工程的初步设计审查，核发《建设工程规划许可证》。
（八）环境艺术与城市设计管理科。
负责组织制定并实施全市城市设计指引;负责组织编制和审批城市设计方案、环境景观规划方案;负责组织编制并审批城市公共空间的规划与设计方案;负责生态绿地、风景名胜区、城市公园、城市广场、街头绿地等各类绿地的规划管理;负责城市雕塑、城市色彩、城市夜景、城市小品等各类环境艺术要素的规划管理;负责历史文化建筑与街区保护规划管理工作。
（九）交通与市政工程规划管理科。
负责组织或参与编制交通、道路、轨道、给排水、电力电信、燃气等综合规划及各层次市政专项规划；协助管理各专业职能部门编制的各类基础设施专项规划；参与城市基础设施建设项目的选址；提出市政规划设计要点；负责城市基础设施建设项目的方案审批和初步设计审查，核发《建设工程规划许可证》和《临时建设工程规划许可证》。
（十）验收备案管理科。
指导和管理建设项目的规划验线，负责建设工程竣工规划验收和竣工验收备案管理工作。
（十一）建筑市场监管科。
拟订勘察设计、建筑业发展规划、规章制度并监督执行；核发《建设工程施工许可证》，监督勘察设计企业、建筑业企业、造价咨询等单位资质标准的执行；负责从业人员的培训、考核和发证管理工作；组织协调建筑业企业参与对外工程承包、建筑劳务合作；负责市场准入和清出工作；负责勘察设计、建筑业、造价咨询行业统计工作。
（十二）建设工程质量安全监管科。
拟订建设工程质量安全管理发展规划、规章制度并监督执行；负责建设工程质量、安全生产监督检查工作；牵头协调处理商品房屋工程质量投诉；负责建筑新技术、新材料、新工艺的推广应用和建筑节能的监督管理工作；负责工程建设标准化管理工作；负责建设工程安全质量事故的调查与处理。
（十三）建设工程招标投标管理科。
贯彻执行国家、省、市有关建设工程招标投标管理的法律、法规及政策；负责对全市建设工程招标文件进行合法性审查及备案；指导监管全市建设工程招投标中介机构；承担市建设工程招标投标管理办公室的日常工作。
（十四）城市更新和村镇规划建设科。
负责编制城市更新改造（含市政工程项目）年度建设计划；负责相关计划实施的跟踪管理；负责市政府交办的建设工程的组织实施工作;拟订村镇规划建设的方针、政策和规章制度；指导村镇建设规划编制和实施；指导农村住房建设、农村住房和危房改造；指导村镇人居生态环境的改善工作。
（十五）行政审批服务科。
负责局驻行政服务中心窗口工作；受理登记建设项目申报事项，并进行程序性审查；负责建设项目申报材料分发送批工作；负责建设项目申报事项的跟踪催办工作；负责有关证照的发放登记。
（十六）人事监察科。
负责党务、纪检监察、廉政建设和精神文明建设工作；负责机构编制和人事管理工作；组织开展政治学习、思想教育、业务培训；负责出国及赴港澳台的审核和报批工作；负责计划生育工作；负责或指导工、青、妇和离退休人员工作；承办局党组和局机关党委的日常工作。
