济南市交通运输局的职责经历了显著调整，以优化城市交通管理和服务。首先，原市交通局的部分职能，包括城市客运管理，已整合并入济南市交通运输局，以提升管理效率。
其次，原城市客运管理的行政处罚权，过去由市城市管理行政执法局行使，现在也划转到交通运输局，确保了更为统一的城市交通执法权力。
此外，济南市交通运输局将不再负责一些已取消的行政审批事项，这有助于简化行政流程，减轻企业和个人的负担。
在规费管理方面，六个交通规费的管理职责已从局里移交给相关行业协会，让行业自律机制发挥更大作用，提升服务效率。
新的职责中，交通运输行业从业人员的技能培训、资质认证以及行业调查分析等工作，将由行业协会承担，这有助于行业专业化的提升和市场的自主发展。
最重要的，济南市交通运输局将聚焦综合运输体系的规划协调，致力于优化交通运输布局，促进各类运输方式之间的无缝衔接，目标是打造一个高效、安全、便捷的综合交通网络。
最后，该局将加强区域和城乡交通的协调发展，强调公共交通优先发展，同时大力推动农村交通建设，以实现区域和城乡交通的一体化进程。
根据省委办公厅、省政府办公厅《关于印发〈济南市人民政府机构改革方案〉的通知》（鲁厅字〔2009〕50号）和市委、市政府《关于济南市人民政府机构改革的实施意见》（济发〔2009〕17号），设立济南市交通运输局，为市政府工作部门。