柯南比较精彩的集数，可以分为几个部分，其中有很多是重复的，可以根据时间和喜好有选择性的看
1.主线（包括关键人物首次出场、服部知道柯南身份、与黑衣组织几次关键的交锋）
2.基德出场
3.服部出场
4.黑衣组织成员出场
5.FBI出场
6.工藤新一形象出场（包括身体恢复和回忆）
1.主线剧情：
001 云霄飞车杀人事件
043 江户川柯南诱拐事件(父母知道新一变小)
048、049 外交官杀人事件(平次登场，白干使柯南第一次恢复）
054 电玩公司杀人事件（组织）
057、058 福尔摩斯迷杀人事件(平次看出柯南身份)
076 柯南VS怪盗基德(怪盗基德出场）
128 黑衣组织10亿元抢劫事件（明美被杀）
129 来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件（小哀出现）
170、171 暗阁中的死角（新出登场）
176——178 与黑暗组织的再会（小哀身体恢复）
188－－193 危命的复活（小兰确定柯南身份 小哀帮助使事情得以继续隐瞒）
226、227 格斗游戏的陷阱（朱蒂登场）
230、231 谜一样的乘客（赤井登场）
258、259 来自芝加哥的男子（詹姆斯登场）
269、270 犯罪的纪念品（提到警察局关于毛利的案卷被偷）
271、272 紧急隐藏的省略（朱蒂）
277、278 英语教师VS关西侦探（平次和柯南到茱蒂家调查）
284、285 中华街雨中的似曾相识（小兰生病引出下集）
286——288 工藤新一NY事件(小兰回忆跟新一在NY发生的事件，初遇赤井秀一）
307、308 无声的证据（柯南拿到有关组织的光碟 引出下集）
309——311 与黑色组织的接触（组织）
335、336 东都显影所的秘密（赤井神秘跟踪）
338、339 4辆保时捷（朱蒂和贝尔摩德假扮的新出发现小哀）
340、341 隐藏在厕所里的秘密（找到明美藏起来的、留给小哀的录音带）
343、344 便利店的陷阱（最后一段小兰发现朱蒂藏的照片，怀疑朱蒂）
345 与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案（茱蒂 赤井 假新出 身份明确）
346、347 寻找P股上的印记（哀拒绝证人保护计划）
385——387 斯特拉迪瓦里小提琴的不xx音(确定BOSS的邮箱按键音是“七子之歌”）
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间(水无怜奈登场)
429、430 无法回到从前的两个人(本堂瑛佑登场)
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒 (赤井的过去）
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
507 卡拉OK房间的死角（前篇）
508 卡拉OK房间的死角（后篇）（柯南在本堂面前承认自己身份，语言中透露赤井并没有死）
509 红白黄色与侦探团（冲矢昴出场）（对于冲矢昴的身份有两种猜测，赤井或波本）
511 推理对决！新一VS冲矢昴
563 侦探团VS强盗团(骚乱)（赤井和朱蒂曾经交往、朱蒂看到疑似赤井的人）
564 侦探团VS强盗团(沉默)（1月30日）
关键人物全部出场集数：
2.怪盗基德
http://baike.baidu.com/view/4542.html?wtp=tt#93.服部平次
http://baike.baidu.com/view/21534.htm#64.黑衣组织
http://baike.baidu.com/view/757190.htm#3（关于冲矢昂，有人认为是组织成员波本，所以后面几集有冲矢昂出场的也归到里面了）
5.FBI（朱蒂、赤井、詹姆斯）
226——227 格斗游戏的陷阱
230——231 谜一样的乘客
258——259 来自芝加哥的男人
269——270 犯罪的纪念品
271——272 急忙掩饰的忽略
277——278 英语教师vs西部名侦探
284——285 中华街 雨中的似曾相识286 工藤新一NY事件（事件篇）
287——288 工藤新一NY事件
307——308 遗留下的无声的证词
309——311 与黑衣组织的接触
335——336 东都显影所的秘密
338——339 4辆保时捷
340——341 洗手间里隐藏的秘密
343——344 便利店的陷阱
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的二元推理
346——347 寻找屁股上的印记！
361——362 帝丹高中学校怪谈
425 黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
563 侦探团VS强盗团(骚乱)
564 侦探团VS强盗团(沉默)（1月30日）
6.工藤新一本人形象出场
http://baike.baidu.com/view/4459.html?wtp=tt#6全部都放在里面太多，看起来很乱，百科里面很清晰的，就直接把网址放上了