我国的研究生（博士研究生、硕士研究生）学位体系分为传统研究型的科学学位和面向技能型的专业学位。科学学位就是科学博士（Ph.D.）和科学硕士，偏向对科学的探索，实际上也就是偏向科研。而专业学位比如临床医学博士、临床医学硕士、口腔医学博士、口腔医学硕士、法律硕士、会计硕士、工商管理硕士（现今很热的MBA）、工程硕士等，更偏向于实际应用。
以临床医学为例，本科生毕业后，可以报考专业学位和科学学位。科学学位享受全奖或半奖、享受国家助学金，可以参加研究生三助工作；而专业学位学费全额自理、不享受统一筹拨的国家助学金，原则上也不能参加学校供给的三助工作。在培养年限上，专业学位整体上相对于科学学位而言，培养时间较短。
在培养计划上，医学科学学位偏向于不脱离临床工作的科研，而上临床的时间相对较少，但毕业论文的要求就相对较高。而医学专业学位更侧重于临床技能培养，对临床科研的培养要求低于科研型，因此对毕业论文的要求没有科学学位严格。因此，在医学院校，科学学位称为科研型，专业学位称为临床型（或技能型）。
在报考研究生时，临床型（即专业学位）的要求更严格：必须是国内高等院校临床医学全日制本科毕业，取得执业医师执照（以前还要求从事医疗工作3年或以上）方有资格报考，而科学学位的报考条件就是一般考研的资格。在选择专业时，选择某一具体学科（如“普外科（肝胆疾病科学）”）方向，则就是科学学位，而统一选择“临床医学技能训练与研究”则就是专业学位。
在就业上，目前科研型（也就是科学学位）更受医疗机构的欢迎，从而被学生戏称为“一分钱一分货”，而专业学位的学生就业压力相对较大。
在我国长学制医学教育中，七年制培养出来的医学硕士，八年制培养出来的医学博士，都属于专业学位。当然，我国最古老最优秀的医学院——中国协和医科大学（北京协和医学院）开设了八年制专业学位毕业后，再在实验室进行三年科研，取得科学学位，从而拥有双博士（临床医学博士专业学位+医学博士科学学位）的高级临床科研人才。
