国家科技重大专项共有16个，实施时间为2006-2020年，每个投资数百亿元，目前公布了13个，具体如下： 国家科技重大专项核心电子器件、高端通用芯片及基础软件产品（简称核高基专项）是《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006-2020年）》所确定的国家十六个科技重大专项之一。科技部是核高基重大专项的领导小组组长单位；工业和信息化部是核高基重大专项的牵头组织单位，是实施核高基重大专项的责任主体。核高基重大专项实施方案经专家委员会论证，于2008年4月经国务院常务会议审议并原则通过，现已正式进入实施阶段。
核高基重大专项的主要目标是：在芯片、软件和电子器件领域，追赶国际技术和产业的迅速发展。通过持续创新，攻克一批关键技术、研发一批战略核心产品。通过核高基重大专项的实施，到2020年，我国在高端通用芯片、基础软件和核心电子器件领域基本形成具有国际竞争力的高新技术研发与创新体系，并在全球电子信息技术与产业发展中发挥重要作用；我国信息技术创新与发展环境得到大幅优化，拥有一支国际化的、高层次的人才队伍，形成比较完善的自主创新体系，为我国进入创新型国家行列做出重大贡献。
核高基重大专项所涵盖的三个方向是21世纪电子信息产业国际竞争的制高点，是体现强国地位的重要标志。实施好核高基重大专项对提升我国电子信息产业核心竞争力至关重要。而且核高基重大专项与人民生活水平的不断提高有着密切的关联，对行业的发展起着重大的支撑作用。这些关键技术和产品的突破，不仅将产生可观的经济效益，也能增加财政收入，创造更多的就业机会，促进社会的和谐发展。
实施核高基重大专项是我国中长期科技发展规划中一项长期而艰巨的战略任务。国家将充分发挥中央和地方政府、企业、科研院所和高等院校的积极性，建立能够调动各方面资源的高效组织管理架构，形成职责清晰、分工合理、相互支持、通心协力的管理机制，从而凝聚全国优势科技资源，做好核高基重大专项实施工作。
核高基重大专项的实施，将设立专门的领导小组、组织实施机构和相应的支撑服务体系，并根据核高基重大专项任务的不同性质和内容，选择有针对性的组织实施模式。坚持企业为主体、市场为导向、产学研用结合的原则，调动企业的积极性，发挥科研机构和高等院校的优势，鼓励应用单位参与重大专项，促进科技成果和产业化的衔接。为保证核高基重大专项的顺利实施和目标任务的圆满完成，实施中将通过制定科学合理、切实可行的过程管理规定和流程，强化过程管理。
在经费投入方面，将在中央重大专项资金支持的基础上，积极鼓励和采取有效的措施，促进多元化和多渠道投融资机制的建立，积极引导和促进地方政府、企业、金融机构以及社会资金的投入，同时加强对经费的使用监督，保证核高基重大专项的顺利实施。
“十二五”期间，核高基重大专项以满足国家信息产业发展重大需求的战略性基础产品为重点，突破高端通用芯片和基础软件关键技术，研发自主可控的国产中央处理器（CPU）、操作系统和软件平台、新型移动智能终端、高效能嵌入式中央处理器、系统芯片（SOC）和网络化软件，实现产业化和批量应用，初步形成自主核心电子器件产品保障体系。 转基因生物新品种培育专项（简称”转基因专项“）的目标，是要获得一批具有重要应用价值和自主知识产权的基因，培育一批抗病虫、抗逆、优质、高产、高效的重大转基因生物新品种，提高农业转基因生物研究和产业化整体水平，为我国农业可持续发展提供强有力的科技支撑。实施转基因生物新品种培育重大专项，对于增强农业科技自主创新能力，提升我国生物育种水平，促进农业增效和农民增收，提高我国农业国际竞争力，具有重大战略意义。
“十二五”期间，转基因专项针对保障食物安全和发展生物育种产业的战略需要，围绕主要农作物和家畜生产，突破基因克隆与功能验证、规模化转基因、生物安全等关键技术，完善转基因生物培育和安全评价体系，获得一批具有重要应用价值和自主知识产权的功能基因，培育一批抗病虫、抗逆、优质、高产、高效的重大转基因新品种，实现新型转基因棉花、优质玉米等新品种产业化，整体提升我国生物育种水平，增强农业科技自主创新能力，促进农业增效农民增收。 载人航天与探月工程专项“十一五”期间重点实施的内容和目标分别是：突破航天员出舱活动以及空间飞行器交会对接等重大技术，建立具有一定应用规模的短期有人照料、长期在轨自主飞行的空间实验室。探月工程从绕月探测起步，研制月球探测卫星，突破月球探测的关键技术，为全面开展探月工程奠定基础。
