淡水小瓜虫病的病原是多子小瓜虫，它们引起致死性体外寄生虫病，因为病鱼体表或鳃上呈现白色小点病变，故又称“白点病”。该病对淡水养殖鱼类危害很大，虫体能快速致死病鱼，所以要控制该病，必须进行及早诊断、及早预防，才能收到理想效果。当然，对该病的最好预防措施是防止鱼体感染和发病。为我国的三类水生动物疫病。
一、病原 小瓜虫属原生动物门、纤毛虫纲、凹口科、小瓜虫属，主要寄生在鱼类的皮肤、鳍、鳃、头、口腔及眼等部位，形成胞囊呈白色小点状，个体较大，身体浑圆像个球体。其成虫大小为350 ~800微米×300 ~500微米，肉眼可见。多子小瓜虫是一种专性寄生虫，只有依赖宿主鱼才能生存，其生活史包括成虫期、幼虫期和包囊期，生活史中无中间宿主。
每个小瓜虫周身长满短而密的纤毛，这些纤毛排列很有规则。成熟虫体内有一个马蹄形大核，虫体前端有一个像“6”字形的漏斗状胞口，小瓜虫由此而进食
二、临床症状
小瓜虫主要寄生在鱼的鳃和体表，鳃的部位主要是第一和第二片鳃的两端角，体表主要在背部和两侧，尾部较少。当病情严重时，躯干、鳃、鳍、头、口腔等处布满小白点，并同时伴有大量粘液，表皮糜烂、脱落，甚至瞎眼；病鱼体色发黑，消瘦，游动异常，鱼体与固体物摩擦，最后病鱼呼吸困难而死
三、诊断
鱼体表形成小白点的疾病，除小瓜虫病外，还有“粘胞子虫病”、“打粉病”等多种疾病，因此不能仅凭肉眼看到鱼体表有很多小白点就诊断为小瓜虫病，最好是用显微镜进行检查。如没有显微镜，则可将有小白点的鳍剪下，放在盛有淡水的白磁盘中，在光线好的地方，用2枚针轻轻将白点的膜挑破，连续多挑几个，如看到有小虫滚动在水中游动，即可做出诊断。
四、流行规律
小瓜虫病全国各地均有流行，对宿主无选择性，各种淡水鱼、洄游性鱼类、观赏鱼类均可受其寄生，尤以不流动的小水体、高密度养殖的条件下，更容易发此病，从鱼苗到成鱼各年龄组的鱼类都有寄生，但主要危及鱼种。小瓜虫完成其生活史所需的时间随水温的变化而不同。该病发生的最适水温是15-25℃，流行于春、秋季，但当水质恶劣、养殖密度高、鱼体抵抗力低时，在冬季及盛夏也有发生。在24℃时，生活史为4天，15℃时为10天，但在10℃以下，往往需要1个月以上，因此低温时成虫不易离开鱼体胞囊，药物作用不明显，施药周期须30天以上。
五、预防方法
此病的药物较多，主要有硝酸亚汞、醋酸亚汞、孔雀石绿、福尔马林、硫酸铜、高锰酸钾等。但前三种会造成药残而危害人类健康，国家已明文禁用于食用鱼，只限用于观赏鱼。后几种疗效逐年减退，甚至无效。
1.预防措施。目前对于小瓜虫病的预防尚无特效药，清除池底过多淤泥，水泥池壁要进行洗刷，并用生石灰或漂白粉进行消毒。对于池塘、育苗室养殖水域，加大换水量，改善水质，定期消毒。育苗室用具经常用福尔马林或高锰酸钾进行消毒，并做到专池专用。鱼下塘或进入网箱前应进行抽样检查，若发现多子小瓜虫应及时采用上述方法预防放养密度不宜过大，日常应加强营养，提高鱼体抵抗力。
2.周期：小瓜虫的生活史中，只有那些基本成熟、即将脱离鱼体或刚脱离的滋养体和掠食体才对药物敏感，而在滋养体的早期、中期和包囊体中幼虫均对药物不敏感。因此，一种即使对虫体很有效的药物，都需要连续使用3-7个疗程，才能完全杀死虫体，两疗程之间间隔一定的时间，间隔期的具体长短视水温而定。最适温度（24-26℃）时需隔天1次预防1周。评定药物的效果，需要在3个疗程之后，根据在显微镜下检查鳃丝中有无虫体或虫体是否死亡来判定。同时决定是否继续进行更多的疗程预防。