员工赔偿应记入公司的应付账款或营业外收入科目。具体分录如下：
当员工因个人原因需要向公司赔偿时，公司需要记录这笔款项。根据不同的业务场景，会计分录的处理方式略有不同。
详细解释：
1. 赔偿款项作为应付账款处理：如果赔偿金额是由于员工在工作过程中发生的个人过失，比如丢失了公司财物或其他个人责任，这部分赔偿金额可以被视为对员工未履行的个人债务的补偿。因此，公司应将其记录在应付账款科目下。具体来说，可以在应付账款下设置一个专门的明细科目“员工赔偿款”。当收到员工的赔偿款时，会计分录为借现金或银行存款，贷应付账款-员工赔偿款。
2. 赔偿款项作为营业外收入处理：如果员工赔偿是由于某种原因，如解雇时的违约赔偿金，这些赔偿金在会计上被视作公司的额外收入。这种情况下，公司应将其记录在营业外收入科目下。具体分录为借现金或银行存款，贷营业外收入。这是因为这些赔偿不是公司日常经营活动的收入，而是非经常性的、意外的收入。因此，营业外收入反映了公司正常利润之外的经济利益流入。在这种情况下，它属于纯收入的一部分。尽管它的会计分录略有不同，但它同样代表了员工对公司的赔偿金额。公司应确保正确记录这些款项，以便准确反映公司的财务状况和经营成果。在处理此类交易时，应确保遵循适用的会计准则和规定。这样做有助于保证财务记录的准确性和完整性，为公司决策提供准确的财务信息支持。不同类型的赔偿处理应在专业指导下进行以防范任何财务风险或误解。
总的来说，员工赔偿的具体分录取决于赔偿的性质和原因。公司需要根据实际情况选择合适的会计处理方式并确保遵守相关会计准则和规定进行正确记账处理这些事务以保障财务的透明度和准确性。