攀枝花市农牧局设有多个内设机构，以确保高效管理和服务农业和农村事务。以下是主要部门的职责概述：
1. 办公室: 负责日常协调，包括文电处理、会务、机要、档案、安全等事务，同时承担新闻发布和政务公开。还负责起草综合性报告，处理应急管理和后勤事务，以及人事劳动管理工作，以及离退休人员的管理工作。
2. 政策法规处（农业行政执法支队、行政审批处）: 主要负责农业法规的制定、审核，进行产业政策研究，指导农业行政执法，并处理行政诉讼、复议和调解等工作，同时负责部分行政审批事项。
3. 农村合作经济管理处（产业发展指导处）: 管理农村土地承包，指导合作社建设，监督农村财务和资产，进行农业资源环境规划，负责土壤肥料和生态农业项目，以及农业产业化经营的指导。
4. 农产品质量安全监管处: 负责农产品质量监管，制定发展计划并监督实施，包括无公害、绿色和有机食品管理，以及农业检验检测和市场秩序整顿。
5. 科技教育处: 推动农业科技创新、教育和农民培训，管理科技成果，负责农业植物品种保护和转基因生物管理，以及农业涉外事务。
6. 农业处（农场管理处）: 制定经济作物和粮油作物发展政策，指导产业基地建设，参与种粮补贴和农业保险，负责国有农场的改革与发展。
7. 畜牧兽医处: 负责畜牧业规划，指导品种改良和防疫工作，管理饲料市场，确保动物防疫和兽医服务体系建设。
8. 农业机械管理处: 制定农业机械化战略，推广新技术，负责农机化行业管理，确保农机安全。
9. 计划财务审计处: 负责农业项目的财务管理和审计，监督农业补贴资金，进行农业统计和信息发布。
最后，机关党委负责党群工作，而纪检监察机构负责内部监督。