马亓山地处山东丘陵地带、沂蒙山区东部,在众山中脱颖而出。此山形成于中生代,由地下溶岩上侵结晶,经大自然长期日晒风蚀雨刷地表裸露而成。距今约一亿五千多万年了。后经新生代第三第四纪的造山运动和东北、西南向密集型节理切割,而形成的华北花岗岩、鲁东区独特的地貌特征,马亓山裸露岩体以条块状分布,山石条纹特殊,其地貌特征特殊、有趣。
马亓山岩体以中生代岩浆岩为主,为中粗粒黑云角闪花岗岩闪长岩、长玢岩、二长斑岩、斜煌斑岩。此岩干净新鲜,色泽偏红是由于含铁量高而致。属于大店超单元之中的桃花涧(桃科)单元。山体节理属多样化、综合型,散布整个山体。
经过明清几次大地震的洗礼,马亓山的自然景观更加丰富多彩,千姿百态,地貌特征更加险峭。大自然的鬼斧神工,为我们留下了多样化宝贵的地质地貌奇观。马亓山地貌类型分:沿河平原、倾斜平地、低岭山坡、岭顶等。