主要的高校有：齐齐哈尔大学、齐齐哈尔医学院、黑龙江科技大学、牡丹江师范学院、佳木斯大学。
1、齐齐哈尔大学为黑龙江省西部地区唯一一所省属综合性普通高等学校，黑龙江省属三所综合性大学之一，是黑龙江省高水平大学和黑龙江省高教强省（一期）重点建设高校。
2、齐齐哈尔医学院：位于闻名世界的丹顶鹤的故乡齐齐哈尔市，是黑龙江省特色应用型本科高校和首批“卓越医生教育培养计划”试点高校。齐齐哈尔医学院创建于1946年，最初为“黑龙江军区军医学校”。历经“黑龙江省卫生学校”、“黑龙江省医士学校”、“齐齐哈尔医士学校”及“齐齐哈尔医学专科学校”等主要发展阶段。
3、黑龙江科技大学：坐落于黑龙江省哈尔滨市，是由黑龙江省人民政府举办的全日制普通本科院校，由黑龙江省人民政府与国家安全生产监督管理总局共同建设，入选教育部新工科研究与实践项目实施高校、黑龙江省特色学科建设高校。
4、牡丹江师范学院：坐落在国家级优秀旅游城市——牡丹江市，黑龙江省东南部地区教师教育研究中心、基础教育研究中心和继续教育培训中心。是中国政府奖学金生委托培养院校，是教育部中俄大学生交流基地，是全国首批学士学位授予单位，学校具有硕士、学士两级学位授权体系。
5、佳木斯大学：黑龙江省重点建设的省属高水平大学，是黑龙江省门类较全且含有医学专业的综合性大学，是“十三五”期间“国家百所中西部高校基础能力建设工程（二期）支持高校”，是黑龙江省首批深化创新创业教育改革示范高校，是中国人类学民族学研究会人口较少民族研究专业委员会依托单位、中国高等教育学会医学教育专业委员会综合性大学医学教育研究学组组长单位。
参考资料来源：百度百科- 齐齐哈尔大学
参考资料来源：百度百科-齐齐哈尔医学院
参考资料来源：百度百科-黑龙江科技大学
参考资料来源：百度百科-牡丹江师范学院
参考资料来源：百度百科-佳木斯大学