自成立以来，中煤国际工程设计研究总院经历了五十年的变迁与发展。最初，它起源于北京煤矿设计院，随着时代的推进和国家机构调整，名称几经变更，包括煤炭工业部北京煤矿设计院、燃料化学工业部煤炭规划设计院，直至成为煤炭工业部规划设计总院和设计管理局。1998年，一个重要的里程碑出现，煤炭工业部和国家经贸委联合批准组建中煤工程设计咨询集团，核心企业为北京煤炭设计研究院，集团囊括了沈阳、南京、重庆、武汉和选煤设计研究院等部属单位。
2001年9月，中煤国际工程设计研究总院的成立进一步扩大了其影响力。这次变革是基于国家工商行政管理总局的批准，标志着该机构正式步入了新的发展阶段。这一历程反映了我国煤炭工业设计领域的专业化与国际化进程，中煤国际工程设计研究总院在行业内的地位与作用也日益凸显。
中煤国际工程设计研究总院的前身为中央人民政府燃料工业部煤炭管理局设计公司，成立于1952年9月；1952年12月12日更名为设计院，是新中国最早成立的专业煤矿设计院之一，至今已有五十年的历史。