苍南县金乡高级中学的历史可以追溯至其创办时期，当时名为平阳县第六初级中学。1972年，学校扩大规模，开始接纳高中新生，转型为一所完整的中学，校名随之改为平阳县金乡区中学。随着1981年苍南县的成立，校名再次调整，改称为苍南县金乡中学，并因其教育质量优异，被县府选中为县重点中学。
在这一历程中，学校领导层也经历了变迁。1995年8月，学校正式更名为苍南县金乡高级中学，开始了新的发展阶段。首任副校长张立启和党支部书记王友余曾在此任内发挥重要作用，现任校长兼书记是林敏，他带领学校继续前行。
苍南县金乡高级中学创办于1956年，原址位于金乡镇龙门巷，是建国后原平阳县最早创办的公办中学之一，1998年迁址到金乡镇西门文苑路，是苍南县教育局直属普通高中。2006年学校占地面积72667m2（109亩），建筑面积25431m2，绿化面积16000m2。图书馆、报告厅、体育场馆、天文观察台、理化生实验室、综合媒体教室和校园计算机网络、校园广播系统等教育教学设施齐全，各班级均配备小媒体，各类教学仪器和电教器材达到省Ⅰ类标准，图书馆藏书近7万册。2006年9月，全校共35个班级，学生1746人，教职工131人，专任教师112人。