首先，马来西亚文化多元，具有开放、包容精神。马来西亚政府对厦门大学在该国办学十分支持。除厦门大学在马开设的学校，在马来西亚设校办学的国外高校来自西方，马方希望有中国高校能够入驻马来西亚。
第二，马来西亚爱国侨领陈嘉庚先生于90多年前创办的厦门大学，与东南亚国家联系密切，与马来西亚更有一种天然的联系。厦门大学已经同马来西亚最高学府马来亚大学建成姐妹校。
第三，马来西亚国内现有600多万名华侨华人，其中近半数来自中国福建省。马来西亚华侨华人家乡情结深厚，对厦门大学怀有深厚的感情，对该校来马办学表示出极大的热情和支持。
第四，厦门大学具有很强竞争优势，一些实用性较强的学科，如经济、管理、法学、化学、海洋学、中医、中文等，已被证明受到外国学生欢迎，相信这些学科非常适合东南亚国家学生。 在国内，厦门大学虽知名但不“拔尖”，为什么偏偏选中厦门大学？
这背后有着深厚的历史渊源。在上世纪50年代，厦大设立了中国高校第一个海外函授学院，为海外华侨华人提供远程教育；2003年初，厦大与马来西亚最高学府马来亚大学结成姐妹校。马来西亚总理中国事务特使黄家定认为，正是这种学术互动，让厦大成为马来西亚学界较为熟悉的中国知名高校。如今，厦大的在校马来西亚留学生已有200多人，是该校人数最多的留学生群体之一。
二者关系还不止如此，厦大校长朱崇实还解释说，这其中有嘉庚情结——厦大是陈嘉庚先生创办的。92年之后，厦大回到嘉庚先生成长的马来西亚创办分校，“这是历史的回馈”。 初步规划，分校将开设五个学院:人文学院、医学院、经济学院、计算机学院、工学院，招收专业:中文、中医、国际商务、会计、计算机、软件工程、电子工程、化学工程、海洋环境等。除中文和中医外，其他专业都采用英语教学。
厦大马来西亚分校的生源将由来自马来西亚、中国和其他国家（地区）等三部分组成；在师资方面，校方透露，除了在当地招聘教师，还将向全世界延聘老师到马来西亚分校任教。
