根据上述职责，市卫生局设13个职能科（室）和机关党委。 （一）办公室
综合协调机关政务和事务工作；负责重大卫生政策、重要政务工作和领导批示办理事项的督促查办；负责综合文稿、新闻宣传、政务公开、文电处理、政务信息、会务组织、机要保密、档案管理、安全保卫、值班等工作；组织办理人大代表建议和政协提案；负责管理机关电子政务、卫生信息化工作和网站建设；负责安全生产工作，综合协调局属单位安全生产监管工作。
（二）人事科
研究拟订全市卫生人才发展规划和政策并组织实施；指导局属事业单位人事制度改革；按照干部管理权限负责局属单位领导班子和干部队伍建设；负责局属单位高级知识分子的管理和卫生系统学科带头人的选拔、培养工作；组织指导卫生管理干部岗位培训工作；负责局属单位的人事和机构编制管理工作；负责局属单位统战及外事工作；会同有关部门做好卫生系统全市性表彰工作；指导医学群众社团的管理工作；负责全市卫生系统思想政治工作。
（三）规划财务审计科
研究拟订全市卫生事业发展总体规划，统筹规划与协调全市卫生资源配置，指导区域卫生规划的编制实施和评价工作；指导规范全市卫生系统财务、资产管理和内部审计；负责医疗卫生服务价格工作；拟定药品、医疗器械和卫生材料采购相关规范；监督管理局属单位的国有资产；负责局属单位的财务、基本建设、大型医用设备的管理和内部审计；负责全市卫生统计管理工作；负责机关财务和国有资产管理工作；协调国外卫生贷款（赠款）的引进、利用和偿还工作。
（四）卫生应急管理办公室
拟订卫生应急和紧急医学救援规划、制度、预案和措施；指导突发公共卫生事件的预防准备、监测预警、处置救援、分析评估等卫生应急活动；组织协调对突发公共卫生事件和其他突发事件实施预防控制和紧急医学救援；组织实施对突发急性传染病的防控和应急措施；对重大灾害、恐怖、中毒事件及核事故、辐射事故等组织实施紧急医学救援；通报和管理突发公共卫生事件信息。
（五）疾病预防控制科（市地方病防治工作领导小组办公室、市艾滋病防治工作委员会办公室）
拟订传染病、地方病、慢性非传染性疾病及公共卫生相关疾病的防治规划；组织对全市重大传染病和主要慢性非传染性疾病的综合防治；拟订公共营养规划，管理营养性疾病的防治工作；组织调度全市卫生技术力量，对重大突发疫情、病情实施报告和管理，防止和控制疫情、疾病的发生、蔓延；承担市地方病防治工作领导小组办公室和市艾滋病防治工作委员会办公室日常工作。
（六）农村卫生管理科（市新型农村合作医疗监督管理办公室）
承担全市农村基本卫生保健和新型农村合作医疗综合管理工作；负责全市新型农村合作医疗的政策制定、组织实施、运行监管、技术指导、总体评价和信息化建设等工作。指导全市农村卫生服务体系建设和乡村医生相关管理工作；监督指导农村卫生政策的落实。
（七）社区卫生妇幼保健与基本药物科
拟订全市社区卫生、妇幼保健、健康教育的政策、规划、规范并组织实施；拟订妇幼卫生技术标准；牵头组织预防和减少出生缺陷工作；负责实施国家药物政策和基本药物制度；负责基本药物制度推广宣传教育工作；指导医院药事管理；指导医疗机构合理用药。 （八）医政与科教科
拟订全市医疗机构、医疗技术应用、医疗质量和服务、采供血机构管理等有关政策、规划、规范、标准并组织实施；建立医疗质量管理控制体系并实施医疗质量管理；制定医务人员执业标准和服务规范；负责医疗机构审批和医疗广告审核；负责采供血及临床用血管理；指导临床重点专科建设、医院感染控制、医疗急救建设、临床实验室管理等有关工作；负责指导医疗事故鉴定工作；负责全市卫生系统的科研课题研发、申报和新技术、新业务推广；指导我市附设性医学科研机构开展工作，并对其进行审核和校验；负责对全市医疗机构的微生物实验室进行生物安全检查和指导；负责全市医疗卫生人员的继续医学教育和农村卫生人员的中专学历教育工作；负责全市临床住院医师规范化培训和卫生专业技术岗位培训工作。
（九）中医科
负责中医医疗、保健、康复、护理及临床用药方面的工作，管理各类中医、中西医结合机构，对其他医疗机构的中医业务进行指导；负责中医、中西医结合医疗机构和中医类别执业医师、护士执业注册；负责中医、中西医结合社会办医和中医医疗广告的审核工作；拟订中医药科技发展规划并组织实施；负责中医药科研协作公关和成果鉴定与推广；组织中医药学术交流与科技合作；负责中医药职业技术教育、成人教育、师承教育和基层中医药人员业务培训工作。
（十）卫生监督与食品安全综合协调科
承担食品安全综合协调委员会办公室日常工作；组织查处食品安全重大事故；组织开展食品安全监测、风险评估和预警工作；依法发布食品安全事故及其处理情况信息；监督实施食品安全标准；负责食品安全信息上报工作，按照职责分工，负责职业卫生、放射卫生、公共场所、生活饮用水、学校卫生和消毒产品等健康相关产品的卫生执法监督；负责医疗机构、传染病防治、母婴保健和采供血等机构的卫生执法监督；负责卫生法制宣传教育，受理行政复议和行政应诉，指导规范卫生行政执法工作，对全市卫生监督监测工作进行指导；制定卫生监督规划，负责卫生监督员的规范化培训，负责市行政服务中心卫生局窗口日常管理工作。
（十一）信访科（首问服务科）
负责办理、接待人民群众来信、来访；负责受理、承办、交办、转办、督办信访事项;负责组织或者参与协调处理重要信访事项和应急处置卫生信访突发事件;负责调查、分析、研究信访情况，提供卫生信访信息，提出改进工作的意见和建议。
对来访、来电、咨询、查询或业务办理单位和人员实行首问负责，全程进行协调服务；给予办事人员明确的介绍、答疑或指引等服务，一次性告知相关办事程序；协调相关科室按照有关程序和承诺办结时间进行办理并全程跟踪督导；对当事人反映问题、请办事项的处理结果或意见归档保存。
（十二）市保健委员会办公室
负责市保健委员会确定的保健对象的医疗保健和预防保健工作；负责重点对象的日常保健、医疗就诊和病情报告的统一管理；负责重大活动、重要会议以及党和国家领导人和重要外宾在洛期间的医疗保障工作；承担市保健委员会具体工作。
（十三）市爱国卫生运动委员会办公室
市爱国卫生运动委员会办公室下设3个科：
1. 综合科
负责爱国卫生和巩固国家卫生城市工作的日常事务、综合协调工作；负责目标管理、文秘、机要、电子政务、会务工作；负责科技情报、统计分析及综合性文件起草；负责定期卫生检查工作的组织安排和发现问题的督查落实；组织开展群众性的爱国卫生活动。
2. 业务督导科
负责爱国卫生和创建国家卫生城市工作中组织开展的市容卫生检查评比工作；负责“除四害”工作和“除四害”专兼职工作人员的培训和管理工作，按照国家标准进行“除四害”检查、考核、命名和技术指导；拟订检查、考核、评比、命名的具体办法，并组织实施。
3. 创建指导科
负责全市卫生创建工作；制定爱国卫生月活动、农村改水、改厕工作计划及发展规划并督促实施。
机关党委
负责局机关和直属事业单位的党群工作。
离退休干部工作科
负责局机关离退休干部服务和管理工作。
纪检（监察）机构按有关规定设置。
