木叶丸虽是木叶隐村第三代火影的孙子，但是对于自己的这个身份很不满意，认为自己只是生活在爷爷的影子之下，希望自己有一天也能成为火影。经常偷袭第三代火影，但屡屡失手。称呼第三代火影为“老头子”。后来与刚刚成为下忍的漩涡鸣人相遇，称鸣人为“大哥”（后来改称“鸣人哥哥”）。鸣人告诉他成为火影是绝对没有捷径可走的，而木叶丸也把鸣人视为自己成为火影道路上的好敌手。
之后木叶丸进入忍者学校，和同学乌冬、萌黄组成了“木叶丸军团”，经常跟踪鸣人，但每次都被鸣人发现。
大蛇丸发动“毁灭木叶行动”时，第三代火影为了保护木叶而牺牲。木叶丸十分悲痛，并且在纲手就任第五代火影之时并不认同纲手，但最后面对纲手超强的实力，还是接受了这个事实。 在第二部中，木叶丸三人已晋升为下忍，成为惠比寿班的成员。一出现则是对鸣人使用“色诱术”，但鸣人说不要玩老一套忍术。鸣人准备表演新色情忍术时被鸣人同班的春野樱一拳打飞。
叔父猿飞阿斯玛被“晓”组织的飞段杀害。在阿斯玛的葬礼上，木叶丸又一次陷入悲痛之中。
当第七班完成击杀飞段、角都的任务后，木叶丸出现，用色诱术·女女术向鸣人挑战，这被小樱评价为无聊忍术。木叶丸不服气，用了另一个“色诱术·男男术”，就是复制裸体的佐助和佐井。小樱流鼻血，鸣人则像被雷电击中一样；而佐井却一脸茫然。
佩恩进攻木叶时，遇到佩恩六道中的地狱道，躲藏，被发觉。惠比寿冲出挡住地狱道，希望木叶丸借此机会逃出，但由于实力差距很快被地狱道捉住。地狱道正要杀掉惠比寿之时，木叶丸冲出并使用鸣人教他的忍术“螺旋丸”击倒了地狱道。
鸣人准备前往五影大会的时候，木叶丸前来和鸣人比试色诱术，但却输给了鸣人，木叶丸苦恼何时才能追上鸣人的时候，鸣人对其利用螺旋丸打到地狱道的行为表示赞扬，说他也是木叶的英雄，下次再准备传授木叶丸大玉螺旋丸，木叶丸高兴不已 。
第四次忍界大战时期，因为只是下忍所以留在村里，没有参战。 第四次忍界大战结束后十几年，木叶丸已经是优秀的上忍。和当年海野伊鲁卡老师喝叱在火影颜岩上乱涂鸦的忍校学生鸣人一样，木叶丸喝叱在火影颜岩上乱涂鸦的忍校学生漩涡慕留人（鸣人的长子），被鸣人在心中吐槽说话的语气越来越像第三代火影 。
后来与慕留人、佐良娜、三月组成木叶丸班，并作为三人的指导上忍。
