根据上述职责，自治区人民政府办公厅设18个内设机构。
（一）主席办公室。
负责自治区主席政务活动、外事活动的安排；配合有关处室协调自治区副主席政务活动、外事活动的安排；负责自治区人民政府秘书长有关政务活动、外事活动的安排；组织起草或参与起草《政府工作报告》等重大综合性材料和重要文件，起草自治区主席的讲话、调研报告；负责自治区人民政府全体会议、常务会议、党组会议的会务工作，撰写上述会议简报、纪要；处理自治区主席的文电、信函、批示，协调督查室和各有关处室确保自治区主席批示和指示的落实；组织收集整理自治区人民政府领导同志政务活动信息，组织编发自治区人民政府领导同志主要政务活动摘报；负责办理自治区人民政府发展研究中心的文电工作。
（二）综合处。
负责办理厅机关的有关政务、事务工作；负责办公厅领导同志政务活动、外事活动的安排；负责自治区人民政府秘书长、办公厅主任的有关文电处理工作；办理本厅有关往来文件，处理本厅有关来信来访；安排厅务会议并负责记录，督办厅务会议决定事项的落实情况；起草厅领导有关讲话材料、厅机关工作计划、工作总结、调研报告、会议简报、会议纪要和有关文稿；编发《工作情况交流》；负责本厅社会治安综合治理和干部职工普法、扶贫支教工作；组织实施自治区人民政府办公厅及全区政府系统办公室（厅）业务培训工作；负责与各市、县人民政府办公室（厅）及区直委、办、厅、局办公室沟通联系；协调办理本厅各处（室）、直属单位的有关工作。
（三）第一秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理监察、财政、人力资源和社会保障、审计、国资监管、税务、法制、金融、招标投标管理、机构编制、机关事务管理、驻外办事处、档案、保密等方面的文电工作；负责接收、转办或办理党委、人大、政协和群团、各民主党派的文电工作。
（四）第二秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理工业和信息化（中小企业）、交通运输、铁路、航空、安全生产、煤监、交通战备、工会、工商联、烟草、黄金管理、储备物资管理、电力、石化、通信管理、邮政管理等方面的文电工作。
（五）第三秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理发展改革、物价、国土资源、测绘、海洋、地矿、环保、统计等方面的文电工作。
（六）第四秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理科技（知识产权）、水利、农业、林业、农垦、粮食、扶贫、供销、水产畜牧兽医、农业区划、农机、自然科学、科协、地震、气象等方面的文电工作。
（七）第五秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理商务（口岸）、外事、质量监督、港澳台侨、广西北部湾经济区开放开发、国际博览事务、保税物流、打私综合治理、贸易促进、检验检疫、海关、海事等方面的文电工作。
（八）第六秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理民族（少数民族语言文字）、民政（老龄）、住房和城乡建设、工商管理、旅游、人防、投资促进、水库移民、宗教、残疾人工作等方面的文电工作。
（九）第七秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理教育、文化、卫生、人口计生、广电、新闻出版、体育、食品药品监管、社会科学、地方志编纂、政府参事、文史、妇女儿童以及红十字等方面的文电工作。
（十）第八秘书处。
负责对应的自治区副主席政务活动、外事活动的具体安排，起草对应的自治区副主席的文稿，起草或参与起草综合性重要文件，处理和督办对应的自治区人民政府领导同志的文电、信函、批示及其交办的各项工作。办理公安、国家安全、司法、监狱、劳教、信访、三大纠纷调处、边海防，以及法院、检察院、军队、国防等方面的文电工作。
（十一）文电处。
负责文电收发、运转、印鉴管理、文书档案、办公厅保密、文印、公文规范审核、机要通信、文件交换等方面的工作。
（十二）信息处（广西壮族自治区人民政府公报室）。
负责指导全区政府系统政务信息工作，建立健全政务信息规章制度，负责政务信息的编辑和报送工作，并向国务院和自治区人民政府领导同志报送有关信息；负责全区政府系统电子政务的规划和指导；办理全区政府系统政务信息、电子政务方面的文电及其督查工作；负责《广西壮族自治区人民政府公报》编辑出版和赠阅工作。
（十三）人事处。
负责厅机关及直属单位、自治区人民政府驻外办事处的人事管理、机构编制、教育培训和出国政审工作。
（十四）接待处。
负责自治区人民政府大型会议、自治区人民政府领导同志召开的全区性会议的会务和接待工作，以及中央国家机关司局级领导同志，各省、自治区、直辖市人民政府领导同志，自治区内各市、县人民政府领导同志，自治区人民政府驻外办事处回邕办事人员的接待等工作。
（十五）行政财务处。
负责自治区人民政府领导同志及厅机关的后勤服务管理工作；负责厅机关及直属单位、自治区人民政府驻外办事处的财务、国有资产管理，以及办公厅系统预算、工资统发核算、各类财务报表统计等方面的工作。
（十六）自治区人民政府督查室。
负责自治区人民政府各部门和各级人民政府对国务院、国务院办公厅和自治区人民政府重要决策、决定和重大工作部署贯彻执行情况的督促检查和落实反馈工作；负责党中央、国务院领导同志和自治区人民政府主要领导同志重要批示的督办、落实和反馈工作；负责全国和自治区人大代表建议、政协委员提案的承办、转办、答复和督办工作；负责对全区政府系统督查工作实行业务指导；负责办理自治区人民政府交办的其他重要事项。
（十七）自治区人民政府应急管理办公室（自治区人民政府总值班室）。
负责全区应急管理工作及自治区人民政府应急管理委员会日常工作，办理自治区人民政府和自治区人民政府办公厅领导交办的其他事项。自治区人民政府应急管理办公室（自治区人民政府总值班室）内设值班室、协调处置处和应急管理处。
1. 值班室。负责自治区人民政府值班工作，确保与党中央、国务院及其所属部门，各省（自治区、直辖市）人民政府和自治区人民政府所属各部门、单位，以及各市、县人民政府联络畅通；接收并办理通过总值班室向自治区人民政府报送的紧急重要事项以及区内外相关重大情况和动态，传达、转办自治区人民政府领导关于突发事件的批示、指示；协助办领导处理突发事件；指导全区政府系统值班工作。
2. 协调处置处。负责协调、指导、督促、检查全区应急队伍、保障体系建设，指导突发事件应急预案演练；协助自治区人民政府领导处置特别重大、重大突发事件；协调指导特别重大、重大突发事件的预防预警、应急处置、调查评估、信息发布、应急保障，根据国家授权组织开展有关国际救援等工作；督办、落实自治区人民政府有关应急决定事项和自治区人民政府领导对特别重大、重大突发事件的批示、指示，承办相关文电和会议；负责特别重大、重大突发事件应急信息搜集、汇总、整理工作，提出处置工作建议。
3. 应急管理处。负责组织、协调有关方面研究提出自治区应急管理的政策、法规和规划建议；指导全区应急预案体系、应急管理体制、机制、法制建设，组织修订自治区突发事件总体应急预案，审核自治区突发事件专项应急预案；指导、协调全区应急平台体系规划、建设；组织、协调自治区人民政府应急管理专家组工作；办理自治区应急管理调研、宣传、教育、培训、对外交流与合作、综合会议等方面的工作和文电。
（十八）自治区政务服务中心管理办公室（自治区政务公开领导小组办公室、自治区政府信息公开领导小组办公室）。
组织并参与起草自治区行政审批和政务服务管理的法规、规章和政策；负责推进行政审批项目集中办理，组织自治区级各职能部门和中直部门为社会公众和行政管理相对人办理行政许可事项与非行政许可审批事项及相配套的管理与服务事项；组织公共资源交易机构进入政务服务中心服务，并进行规范和监督管理；负责审查自治区级各职能部门行政审批事项的授权，受理行政审批的相关投诉；负责对涉及两个以上部门行政审批项目联合审批的组织协调；负责对进驻政务服务中心的单位及其工作人员进行管理、考核、考评和奖惩；协调、指导全区行政审批和政务服务中心管理工作；负责自治区政务公开、政府信息公开工作，指导、协调全区政务公开、政府信息公开工作。自治区政务服务中心管理办公室（自治区政务公开领导小组办公室、自治区政府信息公开领导小组办公室）内设政务管理处、政务协调处和政务技术处。
1. 政务管理处。负责办公室的日常政务工作；负责办公室综合性会议的组织和其他事务性工作；负责内部规章制度建设；负责文电收发、印鉴管理、文书档案管理、保密、安全保卫、资产管理、后勤服务；负责进驻单位服务质量的考评，窗口工作人员的教育、培训、管理、监督、考评、考核工作；负责政务服务宣传工作。
2. 政务协调处。负责审核、协调进入与退出政务服务中心的审批单位；负责行政许可与非行政许可审批事项、收费事项、确认登记、咨询服务及其他公共服务事项的进入、调整、保留、取消等；负责协调公共资源交易机构进入政务服务中心服务；组织并参与起草自治区行政审批制度改革的有关法规、规章和决定；负责推进行政审批项目集中办理，推进行政审批标准化工作；协调、指导全区行政审批和政务服务中心管理工作；负责自治区政务公开、政府及政府办公厅信息公开工作，推进、指导、协调、监督全区政务公开和政府信息公开工作。
3. 政务技术处。负责政务服务中心信息系统的规划、建设以及系统的运行维护与管理工作；负责政务服务中心信息系统的更新、升级、培训和推广；负责配合监察部门组织开展行政效能电子监察的数据分析和编发工作；负责起草制定政务服务中心信息系统建设技术标准及相关的规章制度。
机关党委 负责机关和直属单位的党群工作。
离退休人员工作处 负责机关的离退休人员工作。
