第1个回答 2022-07-25
此前，我们已将讲解过如何将测序得到并拼接好的细菌16S rDNA序列上传至NCBI获取GenBank号：
16S序列上传NCBI步骤
其实，细菌的功能基因上传至NCBI获取GenBank号的顺序与16S序列上传的顺序和操作基本上是一致的，其中存在差异的主要有以下几点（以gyrA基因上传为例）：
gyrA基因上传的文件需要准备两个文档—— gyrA 基因 的 基因序列以及gyrA基因的蛋白序列 ，其中蛋白序列是该基因序列翻译后的序列且蛋白序列必须是连续的，中间不能有空格及下划线（ 存在下划线需要通过加减碱基或者对序列的互补序列进行翻译 ）。
gyrA基因的提交入口需要选择 Submit 中的 第二个窗口 ，进去后选择 Start BankIt Submission选项。
进入后开始填写个人信息，然后根据提示一步一步往下填写， 填写规则参照以上视频或者之前文章 （注意：填写 Nucleotide及Organism时需要点击两次continue ）。提交过程中在 Source Modifiers选项 中提供提交序列的分离源等信息，如果是基因组上的基因直接按照下图进行填写就行（ 点击continue后需要进行信息核查 ）。下一步 Features 是整个提交过程中与16S提交存在 最大区别 的地方——需要提供提交序列编码的蛋白序列，可以提供两种方式进行提交：1）上传提前准备的FASTA格式文本；2）在线填写。
这里我们选择在线提交，点击 Add features by completing input forms 选项，在其中选择CDS那个选项，然后选择下面的 providing protein sequence data 选项，再点击 Add ，此时会弹出一个新的界面，新界面中至少需要填写以下图片中显示的信息（TXT文本中 核酸序列与蛋白序列中显示的ID必须一致 ）。最后我们进行填写信息的 核查 就可以提交了，提交之后等待处理完成，他们会通过 邮箱 发送给您GenBank号码。