咸阳市地震局内设多个部门，各司其职，确保地震管理和应对工作的有效进行。秘书科主要负责局机关的党务、政务工作，包括督促机关工作制度执行、会议组织及重要事项督办，同时管理文秘、办公自动化、信息公开、机要保密、对外宣传和档案管理等工作。在人事方面，科内负责局机关及直属单位的机构编制、组织人事、劳动工资及社会保险等事务，还负责干部思想教育、计划生育、精神文明建设和财务资产管理等。
监测预报科专注于地震监测预报工作，制定并执行监测预报方案，管理全市地震监测网络，维护监测设施和观测环境，进行震情会商和趋势预测，处理异常现象报告，并在地震灾害后加强监测。此外，他们还负责地震行业质量和技术标准的管理以及对外交流与合作。
震灾防御科负责地震预防和应急救援，管理地震安全性评价，审核抗震设防要求，指导防震减灾知识宣传和应急演练，参与破坏性地震应急预案的制定，并负责地震应急技术系统和基础数据库的建设。他们还协助建立地震应急救援队伍和物资储备，参与灾情处理、灾害调查以及重建规划制定。
最后，纪检、监察机构根据相关文件规定设立，负责局内的监督和纪律检查工作。
咸阳市地震局是市人民政府管理全市防震减灾工作的直属单位，承担《中华人民共和国防震减灾法》和《陕西省防震减灾条例》赋予的行政执法职责。始建于1976年的咸阳市地震局，先后在名称、归属、职能以及内设机构等方面经历多次变化。1995年机改后，咸阳市地震局定为市政府的直属机构，正处级，赋予防震减灾有关行政职能，全额拨款。目前，内设秘书科、震害防御科、监测预报科、，下设市地震中心监测站。咸阳市防震减灾工作领导小组办公室设在市地震局。